5-甲基尿甙主要用作生物化學(xué)合成試劑和醫(yī)藥化學(xué)基礎(chǔ)原料，它是藥物分子齊多夫定、司它夫定與阿洛夫定等抗病毒藥物的重要中間體。

5-甲基尿甙在生命科學(xué)領(lǐng)域中有非常重要的作用，其獨(dú)特的化學(xué)結(jié)構(gòu)可與水等其他氫鍵給體材料形成氫鍵。5-甲基尿甙既含有疏水集團(tuán)也含有親水基團(tuán)，因此它不能以任意比例與水混溶。所以在室溫常壓條件下觀察不到溶液達(dá)到頻率臨界點(diǎn)前的波數(shù)改變，只能觀測(cè)到達(dá)到頻率臨界點(diǎn)后的狀態(tài)，這時(shí)5-甲基尿甙的頻率受濃度的影響極其微小。