4,6-二甲氧基-2-甲磺酰基嘧啶在化學(xué)合成領(lǐng)域中主要用作農(nóng)藥分子的合成原料，該物質(zhì)結(jié)構(gòu)中的甲磺酰基單元可在強(qiáng)親核試劑例如醇類物質(zhì)的進(jìn)攻下發(fā)生芳香親核取代。