5'-(4,4'-二甲氧基三苯基)-3'-脫氧胸苷 2'-(2-氰乙基-N,N-二異丙基)亞磷酰胺,英文名為DMT-dT Phosphoramidite,是一種亞磷酰胺類生物化學試劑,它可由雙(二異丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦與胸苷前體物質(zhì)通過縮合反應(yīng)制備得到,該物質(zhì)常用于生物大分子例如DNA,RNA的合成,在生物醫(yī)學研究領(lǐng)域中有一定的應(yīng)用。
制備方法
在一個干燥的反應(yīng)燒瓶中將5'-(4,4'-二甲氧基三苯基)-3'-脫氧胸苷 2'-(2-氰乙基-N,N-二異丙基)亞磷酰胺的前體物質(zhì)胸苷(1.84 mmol, 1.0 eq.)溶于2ml二氯甲烷和2ml丙酮中。然后往上述反應(yīng)混合物中緩慢地加入300 mg N-甲基咪唑(3.68 mmol, 291 μL, 2.0 eq)和665 mg 2-氰乙基-N,N,N,N'-四異丙基磷二胺(2.21 mmol, 700 μL, 1.2 eq),然后再往其中緩慢地加入1.00 g分子篩3?。在此攪拌懸浮液中緩慢地滴入230mg三氟乙酸(2.02 mmol, 159 μL, 1.1當量)于1ml二氯甲烷中,所得的反應(yīng)混合物在室溫下攪拌反應(yīng)大約3h后反應(yīng)完成,然后將反應(yīng)混合物在真空下進行濃縮處理以除去有機溶劑,所得的剩余物通過硅膠柱層析法進行分離純化即可得到目標產(chǎn)物分子5'-(4,4'-二甲氧基三苯基)-3'-脫氧胸苷 2'-(2-氰乙基-N,N-二異丙基)亞磷酰胺。[1]
水解反應(yīng)
圖2 5'-(4,4'-二甲氧基三苯基)-3'-脫氧胸苷 2'-(2-氰乙基-N,N-二異丙基)亞磷酰胺的水解反應(yīng)
將0.1 M四唑溶液(1.5 mL, 0.15 mmol)加入至5'-(4,4'-二甲氧基三苯基)-3'-脫氧胸苷 2'-(2-氰乙基-N,N-二異丙基)亞磷酰胺(100 mg, 0.13 mmol),在干燥乙腈溶液(3 mL)中攪拌。在室溫下攪拌反應(yīng)30min, TLC分析(MeOH:CH2Cl2 1:4)表明起始中間體的消耗情況。然后在反應(yīng)混合物中緩慢地滴入1.0 M 的單質(zhì)碘(THF: 2,6-lutidine: H2O(2:2:1))溶液。然后通過逐步加入Na2S2O3溶液(5mol %)來消耗溶液中多余的單質(zhì)碘,直到溶液變清。所有的有機層并將其用無水MgSO4進行干燥處理,過濾除去干燥劑并將所得得濾液在真空中濃縮,所得的剩余物通過硅膠柱色譜法純化(MeOH:EtOAc 3:7)即可得到目標產(chǎn)物分子。[2]
參考文獻
[1] Lange, Meinolf; et al, Germany Patent, Patent Number:WO2006064039.
[2] Greenberg, Marc M.; et al,Journal of Organic Chemistry (1998), 63(12), 4062-4068.