背景[1]
高保真PCR酶利用自身的3’→5’外切酶活性(pfu DNA Polymerase,PrimeSTAR HS DNA Polymerase等)能保證PCR產(chǎn)物的保真度,但擴增的PCR產(chǎn)物為不帶A尾的平末端DNA片段,不能直接TA克隆。因此,平末端DNA片段需要進(jìn)行加A后方可TA克隆。平末端DNA加A的步驟一般是先純化PCR產(chǎn)物,加入dATP Buffer利用Taq DNA polymerase在平末端片段后加上A尾后才能與T載體的T頭互補連接TA克隆。步驟較為煩鎖,要購買特定的dATP Buffer。經(jīng)過優(yōu)化后的A-Tailing Enzyme可以有效地將dAMP摻入平末端DNA片段的3′端。3′-dA DNA產(chǎn)物在隨后的連接步驟中可防止相互形成多聚體。
應(yīng)用[2]
加A尾的DNA連接到具有互補dT突出端的連接子或克隆載體上。
用A-Tailing Enzyme模塊加A尾的DNA可以連接到具有互補dT突出端的連接子或克隆載體上。
方法改進(jìn):平末端DNA片段加A方法根據(jù)實驗者的技能程度推薦兩種方法:
(1)保守法,先對平末端PCR產(chǎn)物純化后,濃度要求至少20ng/ ul(大概就好,跑膠圖像條帶清晰,明亮),取14.5 ul PCR產(chǎn)物,加入2 ul Taq Buffer,3ul dNTP,0.5 ul Taq酶,在72度反應(yīng)10~20min, 后直接回收純化加A尾的DNA片段可用于TA克隆,此方法操作容易,成功率高;
(2)快速法,高保真酶PCR后的管子(體系為50ul)不用先純化直接加入3ul dNTP 和0.5 ul Taq酶繼續(xù)72度反應(yīng)10~20min,此后直接回收或跑膠回收純化加A尾的DNA片段可用于TA克隆,此方法操作步驟較少和方便,節(jié)省實驗時間和實驗經(jīng)費。
結(jié)果:推薦的兩種方法均能使平末端DNA片段加A尾,方便TA克隆。另外,使用dNTP 代替dATP,節(jié)省實驗經(jīng)費。
參考文獻(xiàn)
[1] 末端加A酶產(chǎn)品介紹
[2]生物通