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2-脫氧尿嘧啶核苷-5'-單磷酸二鈉鹽的制備

2022/5/18 11:50:04

背景及概述

構(gòu)成DNA的基本結(jié)構(gòu)單位是脫氧核苷酸,結(jié)構(gòu)修飾因此主要集中在磷酸骨架、糖環(huán)及堿基部分,這些修飾可以幫助提高寡聚脫氧核苷酸的穩(wěn)定性及在細胞體內(nèi)的雜交配對,同時也可以改變寡聚核苷酸的一些性質(zhì)。在這之中,堿基部分承擔著核酸的專一性識別功能。因此,引入一些指示性功能基團用作分子探針生物傳感器,或?qū)@部分結(jié)構(gòu)進行修飾開發(fā)新的藥物,就成為大部分實驗室競相研究的課題。2’-脫氧尿嘧啶核苷及其衍生物具有良好的生物活性,在抗病毒和抗癌藥物中發(fā)揮著重要作用,2’-脫氧尿嘧啶核苷經(jīng)過氟化可以合成得到2’-脫氧-5-氟尿苷,2’-脫氧-5-氟尿苷是一種高選擇性、高效低毒的抗腫瘤藥物,具有抑制細胞增殖的作用,對胃癌、結(jié)直腸癌等有較好的療效,因此,合成2’-脫氧-5-氟尿苷的前體2’-脫氧尿苷具有重要的醫(yī)學意義。2-脫氧尿嘧啶核苷的5位,因其在這個位置引入官能團符合DNA鏈構(gòu)成的溝槽,不參與堿基間的氫鍵形成,并且不影響DNA的螺旋結(jié)構(gòu),被普遍認為是引入官能團的理想修飾位點。2-脫氧尿嘧啶核苷-5’-單磷酸二鈉鹽英文名稱:2′-Deoxyuridine5′-mono-phos-phatedisodiumsalt,中文別名:2'-脫氧尿苷-5'-單磷酸二鈉,CAS號:42155-08-8,分子式:C9H11N2Na2O8P,分子量:352.146。

制備

文獻報道的2’-脫氧尿苷-5'-單磷酸二鈉鹽的合成方法有:1)以尿苷為原料,經(jīng)過丙酰溴的溴代過程得到溴代并且2’-溴代的嘧啶核苷,然后在鈀碳/醋酸銨體系下進行脫溴氫解,最后堿解脫除?;玫健T摲磻w系用到了較高催化劑量的鈀碳,工業(yè)生產(chǎn)成本較高。2)以尿苷為原料經(jīng)過丙酰溴的溴代?;^程,再使用RaneyNi體系催化氫化,而RaneyNi活性過高,生產(chǎn)過程較為危險,不適合進行規(guī)模化生產(chǎn)。這兩種路線都需要經(jīng)過丙酰溴溴代,需要使用3~4當量的丙酰溴,氣味較大,環(huán)境污染嚴重。在本課題組前期研究的基礎上,以2,2'-O-環(huán)尿苷為原料,在一定條件下與碘化鈉反應,得到2'-I-2'-脫氧尿苷,經(jīng)脫碘后得到2’-脫氧尿苷-5'-單磷酸二鈉鹽[1],2-脫氧尿嘧啶核苷-5'-單磷酸二鈉鹽的合成路線圖如下圖:

圖1 2-脫氧尿嘧啶核苷-5'-單磷酸二鈉鹽的合成路線圖

實驗部分

主要儀器與試劑

布魯克公司AVANCEIIIHD600M核磁共振波譜儀,布魯克公司AVANCENEO400M核磁共振波譜儀,安捷倫1200液相色譜儀。2,2’-O環(huán)尿苷。

實驗步驟

2’-脫氧-2’-碘尿苷的合成

2,2’-O-環(huán)尿苷(10g,44.2mmol),對甲基苯磺酸(0.1g,0.5mmol),碘化鈉(7.6g,50mmol)乙腈120mL,升溫至80℃回流反應5h,降至室溫,加入飽和硫代硫酸鈉溶液至反應液由黃色變?yōu)闊o色透明,減壓濃縮,濃縮物中加入90%乙醇(80mL),加熱溶解,冷卻后有白色固體析出,過濾,濾餅干燥后得到產(chǎn)品2’-脫氧-2’-碘尿苷14.2g,收率91%。

2’-脫氧尿苷-5'-單磷酸二鈉鹽的合成

2’-碘尿苷(5g,14.1mmol),10%的濕鈀碳(0.1g)和三乙胺(1.8g,18mmol),加入到乙醇(100mL),室溫攪拌30min,置換氫氣,維持反應瓶中的氫氣壓力1atm,室溫攪拌2h,TLC顯示原料反應完全,加入2g硅藻土,攪拌10min后,抽濾除去鈀碳,濾液濃縮得到油狀物,再加入磷酸(50mL),加熱溶解,冷卻后有白色固體析出,過濾,洗滌至幾乎無色,濾餅干燥后得到粗品2’-脫氧尿苷-5'-單磷酸二鈉鹽,重結(jié)晶后過濾,干燥,得純品2.96g,收率92%,HPLC純度98%。

結(jié)果與討論

2’-脫氧-2’-碘尿苷的合成條件優(yōu)化:2,2’-環(huán)尿苷經(jīng)質(zhì)子酸催化加碘得到2’-脫氧-2’-碘-尿嘧啶核苷,對該反應條件優(yōu)化可以提高整個合成路線的收率。首先對質(zhì)子酸、溶劑和溫度進行了優(yōu)化篩選,結(jié)果見表1,結(jié)果表明:以甲磺酸為催化劑,以乙腈溶劑,以40%的收率得到2’-脫氧-2’-碘尿苷,隨后嘗試了不同質(zhì)子酸催化劑如三氟甲磺酸、對甲基苯磺酸等,當以對甲基苯磺酸為催化劑時收率可以提高到56%,之后又對不同的溶劑進行條件篩選,發(fā)現(xiàn)以乙醇和乙二醇為溶劑時產(chǎn)物收率反而降低了,所以就使用乙腈作為溶劑,以對甲基苯磺酸作為催化劑,改變反應的溫度,當溫度提高到80℃時收率達到91%,溫度繼續(xù)升高后收率反而有所下降,高溫可能會使原料或者產(chǎn)物變質(zhì)。綜和以上對催化劑、溶劑溫度等條件的篩選,合成2’-脫氧-2’-碘-尿嘧啶核苷的反應條件為:0.5mmol的對甲基苯磺酸,乙腈為溶劑,80℃反應5h。

反應條件:①2,2’-O-環(huán)尿苷(10g,44.2mmol),碘化鈉(7.6g,50mmol),②分離收率。第二步脫碘的反應條件也進行優(yōu)化,由于干鈀碳比較危險,不太適合進行工業(yè)化生產(chǎn),所以采用了濕鈀碳,方便進行放大生產(chǎn),同時對鈀碳的用量進行了優(yōu)化,考慮到其催化的反應時間和成本,最后采用10%的濕鈀碳,以三乙胺做堿,乙醇為溶劑,1atm的氫氣,室溫條件下以92%的收率得到2’-脫氧尿苷。

結(jié)論

通過和以2,2’-O-環(huán)尿苷為原料,首先在對甲基苯環(huán)酸催化作用下得到2’-脫氧-2’-碘尿苷,再用鈀碳加氫脫碘,通過兩步反應以83.6%的收率得到2’-脫氧尿苷-5'-單磷酸二鈉鹽。與已有的方法相比避免使用氣味較大的丙酰溴作為溴化試劑,縮短了反應步驟,提高了收率。該方法廉價易得,合成步驟短,收率較高,具有很高的工業(yè)應用價值。

參考文獻

[1] RomeoR,GiofrSV,IariaD,etal.Synthesis of 5- alkynyl iso xazolidinyl nueleosides [J].EurJOrgChem .2011:5690--5695

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