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沒有異戊烷怎么做空間轉(zhuǎn)錄組?

2020/12/9 17:03:22
各位有做空間轉(zhuǎn)錄組想法的伙伴們,還在為買不到易燃易爆的異戊烷犯難嗎?還在為異戊烷純度不夠煩惱嗎?還在為解決不了異戊烷的問題實(shí)驗(yàn)停滯不前嗎?今天,跟大家分享幾種空間轉(zhuǎn)錄組組織包埋的方法,沒有異戊烷也可以冷凍組織喲~

組織不應(yīng)直接置于液氮中,因?yàn)闇囟炔羁赡軙?huì)導(dǎo)致組織表面沸騰,從而導(dǎo)致氣穴和不均勻的冷凍這可能會(huì)破裂并在形態(tài)上破壞組織。如果您有異戊烷且純度足夠高的話,還是推薦您用異戊烷進(jìn)行組織冷凍的,具體方法如下:

a.用異戊烷(足以完全浸沒組織)填充三分之二的金屬燒杯,然后放入液氮杜瓦瓶中(與異戊烷相同的高度)以充分接觸,孵育 15 分鐘。

b.將新鮮組織置于培養(yǎng)皿中,用干凈的紗布或者紙巾吸干組織周圍血水,盡量使組織表明干燥。

c.標(biāo)記冷凍模具以標(biāo)記組織的方向,用預(yù)冷的 OCT 填充模具,避免產(chǎn)生氣泡。

d.用鑷子將組織放入含預(yù)冷OCT的模具中,用OCT 覆蓋任何裸露組織的表面,確認(rèn)沒有氣泡,尤其是在組織附近。

e.用鑷子將模具放到異戊烷中,但不要使異戊烷浸入模具內(nèi),直到組織凍結(jié)。冷凍時(shí)間可根據(jù)組織類型和大小而變化。

f.冷凍后,將組織轉(zhuǎn)移到預(yù)冷的冷凍管中,然后放在干冰上。

g.將 OCT 包埋的組織塊保存在–80℃的密封容器中,以便長(zhǎng)期保存,或立即進(jìn)行冷凍切片

如果您的新鮮樣本打算直接進(jìn)行空間轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn),且實(shí)驗(yàn)室沒有異戊烷的話百邁客在這里給您推薦直接用干冰粉進(jìn)行組織冷凍包埋,具體方法如下:

a.直接準(zhǔn)備干冰粉或用研缽將干冰塊研磨成粉

b.將新鮮組織置于培養(yǎng)皿中,用干凈的紗布或者紙巾吸干組織周圍血水,盡量使組織表明干燥。

c.標(biāo)記冷凍模具以標(biāo)記組織的方向,用預(yù)冷的 OCT 填充模具,避免產(chǎn)生氣泡

d.用鑷子將組織放入含預(yù)冷OCT的模具中,用OCT 覆蓋任何裸露組織的表面,確認(rèn)沒有氣泡,尤其是在組織附近。

e.將組織放入干冰粉中,直到組織凍結(jié)。此方法冷凍包埋組織較慢,且須在干冰粉上靜置一段時(shí)間,確保組織冷凍均勻,約需30分鐘。

f.冷凍后,將組織轉(zhuǎn)移到預(yù)冷的冷凍管中,然后放在干冰上。

g.將 OCT 包埋的組織塊保存在–80℃的密封容器中,以便長(zhǎng)期保存,或立即進(jìn)行冷凍切片。

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