發(fā)酵法生產(chǎn)赤蘚糖醇始于20世紀(jì)90年代，國際上均采用微生物發(fā)酵法大批量生產(chǎn)赤蘚糖醇。生產(chǎn)赤蘚糖醇的碳源有烷烴、單糖和雙糖等，葡萄糖、果糖、甘露糖和蔗糖都是生產(chǎn)赤蘚糖醇的良好碳源，其中D-甘露糖的轉(zhuǎn)化率最高，達31.5%。但是由于成本因素，主要以小麥或玉米等淀粉質(zhì)原料，經(jīng)酶降解生成葡萄糖，由耐高滲透酵母或其它菌株發(fā)酵生產(chǎn)，能生產(chǎn)赤蘚糖醇的有假絲酵母屬、球擬酵母屬、毛孢子菌屬、三角酵母屬、畢赤酵母屬等。赤蘚糖醇發(fā)酵法工業(yè)化生產(chǎn)流程如下：淀粉→液化→糖化→葡萄糖→生產(chǎn)菌株發(fā)酵→過濾→色層分離→凈化→濃縮→結(jié)晶→分離→干燥，最后得到赤蘚糖醇，平均收率約50%。研究表明，赤蘚糖醇發(fā)酵法受多種因素影響，如滲透壓的改變明顯影響多元醇的生成，無機鹽Mn2+、Cu2+能提高赤蘚糖醇的產(chǎn)率，氧氣、溫度都對其產(chǎn)量有影響，與化學(xué)合成法相比，發(fā)酵法更具有生產(chǎn)優(yōu)勢