背景[1-6]
Pierce Silver Stain for Mass Spectrometry是一套完整的試劑盒,用于快速靈敏地對聚丙烯酰胺凝膠中的蛋白質(zhì)進(jìn)行銀染,并對切除的凝膠塊進(jìn)行高效脫色,以進(jìn)行質(zhì)譜分析。
特性[1-6]
Pierce Silver Stain的特點:
•敏感和快速染色-低背景,易于使用的銀染提供亞納克敏感性,在固定后30分鐘內(nèi)檢測每個斑點小于0.25ng的蛋白質(zhì)
•靈活的染色方案-將凝膠固定15至30分鐘或過夜,對染色性能沒有任何影響;染色1至30分鐘(通常2至3分鐘)
•堅固-有效的銀染,即使是難以染色的堿性蛋白質(zhì),如溶菌酶(pI 10)和胰凝乳蛋白酶原A(pI 9.2),分別可檢測到0.2ng和0.5ng
•簡單,無故障的斑點制備-染色切除的凝膠塊中的斑點很容易脫色,并且可在一小時內(nèi)進(jìn)行胰蛋白酶消化。
•MS兼容的試劑和方案經(jīng)過優(yōu)化,可在從染色的1D或2D凝膠(SDS-PAGE)中提取肽后提供卓越的質(zhì)譜性能
•完整試劑盒-包含染色和脫色前所需的所有試劑,用于凝膠內(nèi)蛋白水解和肽回收,用于質(zhì)譜分析
•方便-kit-components在室溫下穩(wěn)定;節(jié)省寶貴的冰箱空間,無需在使用前平衡試劑
銀染法通常使用戊二醛或甲醛,其引起蛋白質(zhì)彼此和凝膠基質(zhì)的一些共價交聯(lián)。在發(fā)生這種交聯(lián)的程度上,將抑制從凝膠中提取或洗脫蛋白質(zhì)。Pierce Silver Stain在污漬和顯影劑工作溶液中使用甲醛。然而,優(yōu)化伴隨質(zhì)譜試劑盒的程序以化多肽回收而不會大大犧牲靈敏度。
應(yīng)用[7][8]
用于急性力竭運動大鼠腓腸肌的蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)組差異性表達(dá)的研究。
運動大鼠腓腸肌蛋白質(zhì)組的差異性表達(dá)特征,篩選出骨骼肌組織中對運動應(yīng)激具有重要意義的差異性表達(dá)的蛋白質(zhì),探討在蛋白質(zhì)組學(xué)水平上運動性疲勞的發(fā)生機(jī)制。實驗方法:10只雄性SD大鼠,按體重隨機(jī)配對分為安靜對照組(n=5)和運動實驗組(n=5)。運動組依據(jù)Bedford所建立的大強(qiáng)度運動模型,運動至力竭。大鼠力竭后三小時和安靜組同時做麻醉后斷頭處死,進(jìn)行后肢腓腸肌蛋白質(zhì)提取和含量測定。提取的蛋白質(zhì)經(jīng)過處理后進(jìn)行兩部分實驗。章:急性力竭運動大鼠腓腸肌蛋白質(zhì)差異性表達(dá)的初步研究。依次對蛋白質(zhì)進(jìn)行SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳、染色、蛋白膠內(nèi)原位酶解、電噴霧-四極桿-飛行時間串聯(lián)質(zhì)譜分析;第二章:急性力竭運動大鼠腓腸肌的比較蛋白質(zhì)組研究。依次對蛋白質(zhì)進(jìn)行固相pH梯度—SDS雙向凝膠電泳、硝酸銀染色、蛋白質(zhì)膠內(nèi)原位酶解、基質(zhì)輔助激光解吸飛行時間串連質(zhì)譜分析。
部分實驗結(jié)果:組織蛋白提取比較成功,Bradford蛋白定量大約40ug.ul-1。電泳顯示36個條帶,與安靜組比較,在運動組有的條帶出現(xiàn)了明顯增寬、密度增高,有的條帶出現(xiàn)了明顯變窄、密度降低。對具有明顯變化的條帶進(jìn)行膠內(nèi)原位酶解和質(zhì)譜分析顯示第三條帶的運動組中出現(xiàn)了甲胎蛋白。第二部分實驗結(jié)果:安靜組和運動組蛋白質(zhì)斑點數(shù)目分別為667±35個和572±28。共有282個差異表達(dá)的蛋白質(zhì)點。運動后消失的蛋白質(zhì)點有88個,運動后新增的蛋白質(zhì)點32個,運動后表達(dá)量差異。
參考文獻(xiàn)
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[4]Biology of disease:free radicals and tissue injury.Freeman BA,Crapo JD.Lab,Invest.1982
[5]Role of the C-terminal domain of Bax and Bcl-xl in their localization and function in yeast cells.Priaut M,Camougrand N,Chaudhuri B,et al.FEBS Letters.1999
[6]Research in the exercise sciences:Where do we go from here?.Baldwin KM.Journal of Applied Physiology.2000
[7]Proteomic analysis and identification of new biomarkers and therapeutic targets for invasive ovarian cancer.Jones MB,Krutzsch H,Shu H,et al.Proteomics.2002
[8]張松江.急性力竭運動大鼠腓腸肌的蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)組差異性表達(dá)的研究[D].湖南師范大學(xué),2006.