背景及概述[1]
核酸外切酶是指水解酶類中幾種亞類酶的總稱(EC3.1.11.13.14.15.16)。它們催化單個核苷酸殘基的水解,只水解DNA或RNA鏈的末端核苷酸。該酶在核酸的分解代謝、維持和修復(fù)中起重要作用,可用于多核苷酸的序列測定。催化核酸鏈末端的磷酸二酯鍵水解而逐個切下核苷酸的一類酶。EC3.1.11~16。按底物專一性分為DNA外切酶、RNA外切酶以及對DNA和RNA均可作用的核酸外切酶.其中,有的從5′-端開始,逐個切下3′-核苷酸;有的從3′-端開始,逐個切下5′-核苷酸;也有的可從5′-或3′-端開始,逐個切下5′-核苷酸。
ExonucleaseIII(核酸外切酶III)具有以下4種催化活性:(1)3’→5’外切脫氧核糖核酸酶活性,尤其適合雙鏈:ExonucleaseIII(核酸外切酶III)降解dsDNA的平末端、5’-突出末端或切口,從DNA鏈的3’-端釋放5’-單磷酸核苷酸,產(chǎn)生單鏈DNA片段。該酶對具有3’-突出末端(至少有4個堿基,且具有3’-末端C殘基)的DNA(1)、單鏈DNA、硫代磷酸酯連接的核苷酸無活性。2)3’-磷酸酶活性:ExoIII切除3’-末端的磷酸基團,產(chǎn)生3’-OH基團。3)RNaseH活性:ExoIII外切核酸酶活性,降解RNA-DNA雜合體中的RNA鏈。4)脫嘌呤/脫嘧啶-內(nèi)切核酸酶活性:ExonucleaseIII(核酸外切酶III)切割脫嘌呤或脫嘧啶位點的磷酸二酯鍵,產(chǎn)生5’-端無堿基的脫氧核糖5’-磷酸殘基。ExonucleaseIII(核酸外切酶III)切割DNA的速度極大程度上依賴于反應(yīng)溫度、鹽濃度以及DNA與酶的摩爾比例(4,8)。每次實驗的優(yōu)化條件都需重新測試。
主要參考資料
[1] 農(nóng)業(yè)大詞典