背景[1-5]
定量蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)是一種用于確定樣品中蛋白質(zhì)含量的分析化學(xué)技術(shù)服務(wù)。蛋白質(zhì)鑒定的方法與一般（定性）蛋白質(zhì)組學(xué)中使用的方法相同，但把量化作為附加維度。定量蛋白質(zhì)組學(xué)不是僅僅提供在某個樣品中鑒定的蛋白質(zhì)列表，而是產(chǎn)生關(guān)于兩個生物樣品之間的生理差異的信息。
例如，該方法可用于比較來自健康和患病患者的樣品。定量蛋白質(zhì)組學(xué)主要通過二維凝膠電泳進(jìn)行（2-DE）或質(zhì)譜（MS）。然而，最近開發(fā)的定量斑點印跡（QDB）分析方法能夠以高通量形式測量樣品中單個蛋白質(zhì)的絕對量和相對量，從而為蛋白質(zhì)組學(xué)研究開辟了新的方向。與需要MS進(jìn)行下游蛋白質(zhì)鑒定的2-DE相比，MS技術(shù)不僅可以識別蛋白種類還可以量化構(gòu)成變化。
胞內(nèi)蛋白質(zhì)組豐度的動態(tài)變化對各種生命過程有重要影響。例如在許多疾病的發(fā)生和發(fā)展進(jìn)程中，常常伴隨著某些蛋白質(zhì)的表達(dá)異常。目前定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)主要分為標(biāo)記(label)策略和非標(biāo)記的(label free)定量策略,其中標(biāo)記策略又分為體內(nèi)標(biāo)記(如SILAC、15N標(biāo)記)，以及體外標(biāo)記(如iTRAQ、TMT標(biāo)記)。
傳統(tǒng)的基于2D雙向凝膠電泳分離的蛋白質(zhì)組通?？梢澡b定出約1000種蛋白，對全蛋白質(zhì)組的覆蓋僅在5~10%左右，遠(yuǎn)遠(yuǎn)不能滿足高通量定量蛋白質(zhì)表達(dá)譜分析的要求。定量蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)結(jié)合精細(xì)的樣品制備與超高分辨率、高靈敏度的液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)，可在細(xì)胞與組織類樣品中鑒定直至超過10000個蛋白，對全蛋白質(zhì)組的覆蓋>60%。結(jié)合生物信息學(xué)分析，可以為客戶構(gòu)建高通量蛋白質(zhì)定量表達(dá)譜。
應(yīng)用[6][7][8]
1.生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用
定量蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域具有獨特的應(yīng)用，特別是在藥物和生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)領(lǐng)域。定量蛋白質(zhì)組學(xué)可以標(biāo)記不同蛋白質(zhì)的復(fù)雜性質(zhì)和定量分析，比更多傳統(tǒng)方法（蛋白質(zhì)印跡和ELISA）對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的差異以及翻譯后修飾更敏感，因此可以量化對蛋白質(zhì)的不同修飾。
2.藥物發(fā)現(xiàn)
定量蛋白質(zhì)組學(xué)在蛋白質(zhì)靶標(biāo)鑒定，蛋白質(zhì)靶標(biāo)驗證和藥物發(fā)現(xiàn)的毒性分析中具有重大作用。新藥物的發(fā)現(xiàn)可被用于研究蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用，以及藥物-小分子相互作用。因此，定量蛋白質(zhì)組學(xué)在監(jiān)測小藥物樣分子的副作用和理解一種藥物靶標(biāo)相對于另一種藥物靶點的功效和治療效果方面顯示出巨大的作用。藥物發(fā)現(xiàn)中絕對蛋白質(zhì)定量的方法是LC-MS/MS和多反應(yīng)監(jiān)測（MRM）。
3.單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)
傳統(tǒng)的質(zhì)譜蛋白質(zhì)組學(xué)已應(yīng)用于數(shù)百萬個細(xì)胞組成的大量樣品。然而，這種群體平均測量對于異質(zhì)樣品（即人體組織或癌癥）中單個細(xì)胞之間差異檢測依然存在許都問題。SCoPE-MS可以量化單個哺乳動物細(xì)胞中的一千多種蛋白質(zhì)，進(jìn)一步的技術(shù)發(fā)展和想法可以顯著提高單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)的靈敏度和通量。
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