一站式miRNA尿素-PAGE電泳套裝
產品及特點尿素-聚丙烯酰胺凝膠電泳(Urea PAGE)是目前分離 200 nt 以下的小片段 RNA,尤其是 20 nt 左右的 microRNA(miRNA)分子的主要方法,但是單獨配 制各種溶液十分繁瑣,為此天澤基因開發(fā)了本產品。它具有下列特點:
1. 一站式,含有電泳所需要的所有試劑,即開即用,十分方便,免去了實 驗人員稱取有毒物品。
2. 靈活,可以根據需要配制各種濃度的 Urea-PAGE,以便對長度各異的 RNA 進行電泳。
3. 電泳后可直接用于 UV 觀察、銀染、膠回收、Northern 雜交等實驗。
4. 使用新型緩沖液,可以防止甘油的干擾。
規(guī)格及成分 成份 編號 大紙盒包裝
運輸及保存 尿素 100873 210 g RT 丙烯酰胺 100864 60g,用 250mL 瓶 RT 甲叉雙丙烯酰胺 100877 3g RT TBE 電泳液, 10× 90313 250 mL RT TEMED 110-18-9 1.5 mL RT 過硫酸銨 100879 1 g RT miRNAON 70608 1.5 mL 低溫/-20℃ miRNA Marker 70605 150 uL 低溫/-20℃ 固相 RNase 清除劑 3090 250 mL RT 使用手冊 70606sc 1 份 RT
運輸及保存 常溫運輸和保存,miRNAon、miRNA Marker 需要低溫運輸,-20℃保存, 保存期一年。
自備試劑 miRNA 樣品、RNase-free 水。
使用方法
1. 準備工作:用固相 RNase 清除劑清潔工作平臺 直接將固相 RNase 清除劑原液或 10 倍的新鮮稀釋液噴于臺面,5 分鐘后 用普通吸水紙擦凈,后用沾有固相 RNase 清除劑 1000 倍新鮮稀釋液的 吸水紙擦凈,晾干。
2. 準備工作:用固相 RNase 清除劑清潔玻璃和塑料器皿 將器皿浸泡在固相 RNase 清除劑的 10 或 100 倍的新鮮稀釋液中,靜置 處理 5 分鐘后取出,再用固相 RNase 清除劑 1000 倍或 10000 倍新鮮稀 釋液浸泡二次以上,倒立晾干后備用。
3. 配制 1×TBE 電泳液: 將適量的 10×TEB 電泳液用 RNase-free 水稀釋 10 倍,得到 1×TBE 電泳液待用。此溶液需要現(xiàn)用現(xiàn)配,否則易長菌。
4. 配制 10%過硫酸銨溶液: 精確稱取100 mg 過硫酸銨到一干凈的 1.5 mL 離心管中,按每 1 mg 過硫酸銨加 10 μL RNase-free水的比例加入 RNase-free 水,搖晃溶解待用。10%過硫酸銨溶液有效期不超過一周。
5. 估計所需要的凝膠溶液的體積,一般配制一塊 13 cm×15 cm× 0.8 mm 的膠需要 15 mL 凝膠溶液,配制一塊 36 cm×45 cm×0.8 mm 的膠需 要 120 mL 凝膠溶液。
6. 配制 40%的丙烯酰胺-甲叉雙丙烯酰胺溶液:將 3g 甲叉雙丙烯酰胺加入到 裝有 60g 丙烯酰胺干粉的瓶中,再加入 130 mL RNase-free 水,充分搖 晃混勻即得 40%的 Acrylamide/Bis 溶液。
7. 根據所需要的凝膠溶液的體積,在一的干凈的三角瓶中按下表加入各成分
8. 攪拌并加熱到 40-50℃左右,直到尿素完全溶解。
9. 冷卻到室溫后,將三角瓶接上真空系統(tǒng)抽真空處理 10-15 分鐘以充分去除 溶液中的氧氣(氧氣會降低聚合反應效率)。若條件有限,此步可省略。
10. 邊搖晃溶液變加入 50 μL TEMED 和 500 μL 10%過硫酸銨。注意:如果 選擇其他工作濃度的 Acrylamide/Bis,此二成分的用量不需要隨之改 變。但如果配置的凝膠溶液的體積變化,此二成分的用量要按比例改變。
11. 再充分搖晃約 30 秒后迅速灌膠,然后插入樣品梳,室溫放置 30-60 分鐘 等待膠凝固。
12. 將凝膠板放置在電泳裝置上后,在上下層分別加入適當量的 1×電泳緩沖 液。如果不馬上使用,需要有濕紙將上樣孔端蓋住以防凝膠過度干燥。
13. 拔出梳子后用加樣槍吸取電泳緩沖液,充分將每個加樣空中未聚合的 Acrylamide/Bis、尿素和氣泡吹打出來。
14. 在上樣前,預電泳 20-30 分鐘以使多余的過硫酸銨跑出加樣空,同時還可 以使凝膠的溫度升高(到 50℃左右),有利于 RNA 變性狀態(tài)。
15. 將 miRNA 樣品與等體積的 miRNAon 混合,70℃保溫 2-3 分鐘后迅速放 置在冰上冷卻,快速離心半分鐘,放冰上待用。miRNA Marker 需要每個 上樣孔用 5μL,一塊膠好在兩側各用一個孔上樣 miRNA Marker。
16. 關電泳儀后開始上樣。
17. 重開電泳儀,對 13 cm×15 cm 的膠,以 20-30mA 的電流電泳,直到紅 色染料移動到凝膠邊緣為止;對36 cm×45 cm 的膠,則以 50-60mA 的 電流電泳,直到紅色染料移動到凝膠邊緣為止。
18. 染色觀察:將凝膠一面的玻璃板揭開,直接用仍然附著在另一玻璃板上的 凝膠進行各種染色,包括銀染(固定、漂洗、顯影和定影等步驟)、EB(每 100 mL 1×TBE 中加 20 μL 10mg/mL 的 EB 溶液)、天澤基因低毒核 酸染料 DNAgreen(每 100 mL 1×TBE 中加 10 μL DNAgreen 原 液)。 UV 下觀察并拍照。
19. miRNA 回收:按上法用 EB 等染料染色后,UV 下確定所需要的 miRNA 條帶的位置,切膠后進行膠回收處理。
20. Northern 雜交:按上法用 EB 等染料染色后,UV 下確定所需要的 miRNA 條帶的位置,切膠后電轉移到帶正電的尼龍膜上,然后進行雜交處理。
21. 放射自顯影:如果 miRNA 樣品電泳前經過同位素標記,則將凝膠一面的 玻璃板揭開,用濾紙將附著在另一玻璃板上的凝膠吸附過來,然后包上保 鮮膜,真空抽干,然后使膠跟 X 光片向對置進行放射自顯影。
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