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非凍型血液DNA保存液

2020/3/24 8:40:08

背景[1-6]

非凍型血液DNA保存液在室溫條件下長期保存用于DNA提取的血液樣品的保存液。它通過裂解細胞并高效抑制DNase的活性而達到長期保證DNA分子的完整性的效果。

操作流程:

1.非凍型血液DNA保存液250mL成分根據(jù)要保存的各樣本的體積,計算出所需RNAwait用量。RNAwait的用量應(yīng)當(dāng)是組織體積的10倍(如100mg組織約用1ml RNAwait);離心收集2×106細胞RNAwait的用量是1ml。

2.將RNAwait按需要量分裝入自備保存管中;

3.保存時先將樣本浸入RNAwait后置4℃冰箱過夜(4℃過夜是必需的,這樣可使RNAwait完全滲入到組織中),然后轉(zhuǎn)移到-20℃冰箱(RNAwait在-20℃時仍為液態(tài),有結(jié)晶析出,是正常情況);或者在4℃冰箱過夜后,從RNAwait中取出組織塊,轉(zhuǎn)移到-80℃冰箱。在RNAwait中保存的標(biāo)本,反復(fù)凍融至室溫20次不影響RNA的質(zhì)量。

產(chǎn)品特點:

1.非凍型血液DNA保存液250mL成分操作簡單,將組織剪薄浸沒在RNAWAIT中即可使其RNA不被降解。

2.替代液氮,使樣品的保存不需液氮,干冰或-80℃冰箱,尤其適用于臨床和野外樣品的快速和大規(guī)模采集。

完整,因RNAwait能迅速抑制組織中RNA酶的活性,故從中提取的RNA的質(zhì)量跟液氮保存的樣品相比不相上下。

4.方便運輸,處理過的樣品能在25℃保存一周,使樣品郵寄和運輸變得容易和便宜,有利學(xué)術(shù)合作和交流。

5.反復(fù)凍融,經(jīng)RNAwait處理的樣品可反復(fù)凍融20次,其間可對樣品進行各種處理而不影響最終提取的RNA的質(zhì)量。

6.結(jié)果準確,RNAwait進入細胞十分快速,基因表達在發(fā)生應(yīng)急改變前就得以鎖定,故RNA分析更能反映取樣時的真況。

7.可比性強,RNAwait能減少大規(guī)模樣品處理中的誤差,增加各次實驗數(shù)據(jù)間的可比性,對大規(guī)?;虮磉_譜的分析尤其有用。

8.兼容性廣,處理過的樣品可以使用TRIzol等試劑提取其RNA,樣品還可直接用于組織切片,免疫學(xué)和流式細胞分析而不影響RNA的質(zhì)量。

應(yīng)用[7][8]

非凍型血液DNA保存液可用于血液循環(huán)DNA長期保存:

循環(huán)DNA(circulating DNA),又稱為游離DNA(cell-free DNA),是存在于血液(血漿或血清)、腦脊液以及滑膜液等體液中的細胞外DNA。隨著微量DNA定量檢測技術(shù)的飛速發(fā)展,循環(huán)DNA,特別是血液循環(huán)DNA,作為一種微創(chuàng)檢查中的生物大分子標(biāo)志物,日益受到人們的關(guān)注。人血液循環(huán)DNA含量的變化在多種類型疾病的診斷、療效觀察和預(yù)后判斷中具有重要價值。

然而,由于血液采集、分離、保存方式和樣本選擇的不同,以及循環(huán)DNA提取、純化和定量方法的差異,各研究結(jié)果間缺乏可比性,目前關(guān)于健康人血液循環(huán)DNA水平和正常參考值范圍,尚未見大樣本的研究報道。目的建立含有內(nèi)參照物的血液循環(huán)DNA定量檢測方法,對健康人血液循環(huán)DNA水平進行初步研究,確定其正常參考值范圍。方法自行設(shè)計并合成人工雙鏈DNA片段,重組到pMD18-T質(zhì)粒載體中,經(jīng)基因克隆和多步篩選實驗,構(gòu)建重組質(zhì)粒,提取質(zhì)粒DNA,紫外分光光度法對其進行定量,梯度稀釋獲得標(biāo)準內(nèi)參照物。

通過比較四種不同的DNA提取方法對重組質(zhì)粒DNA的提取效率,選擇合適的血液循環(huán)DNA提取方法。采用實時熒光定量PCR技術(shù),以三條引物(共用一條下游引物)和兩條Taqman熒光探針,同時擴增血漿和血清中的目的基因(人看家基因β-actin)和內(nèi)參照物(重組質(zhì)粒DNA),以擴增效率為指標(biāo),確定雙重實時熒光定量PCR反應(yīng)中的Mg2+和下游引物的濃度。

由已知的標(biāo)準內(nèi)參照物濃度計算得到目的基因的濃度。針對不同的血漿血清用量(200、100、50、10、2和1μl)進行定量檢測,確定該方法的敏感性。以紫外分光光度法定量的人基因組DNA投入空白血漿和血清中,以雙重實時熒光定量PCR進行定量檢測,確定其準確性。針對不同程度稀釋的血漿血清DNA樣品進行定量檢測,確定檢測方法的穩(wěn)定性,并對該檢測方法的重復(fù)性進行評價。

參考文獻

[1]A prospective analysis of cell‐free fetal DNA concentration in maternal plasma as an indicator for adverse pregnancy outcome[J].MargitBauer,GeorgHutterer,MartinaEder,SandraMajer,ErikLeShane,Kirby L.Johnson,IngaPeter,Diana W.Bianchi,BarbaraPertl.Prenat.Diagn..2006(9)

[2]Plasma Content of Extracellular Nucleic Acids in Donors and Patients with Mammary Tumors[J].S.N.Tamkovich,P.P.Laktionov,E.Yu.Rykova,A.V.Starikov,T.E.Skvortsova,N.P.Kuznetsova,V.I.Permyakova,V.V.Vlasov.Bulletin of Experimental Biology and Medicine.2005(4)

[3]Análisis de la concentración sérica del ADN tumoral en el cáncer de pulmón no microcítico y avanzado:?esútil como factor pronóstico?[J].Carlos Camps Herrero,Pilar Bayo Zaera,Rafael Sirera Pérez,Eva Sancho Salvador,Ana Blasco Cordellat,María JoséSafont Aguilera.Clinical and Translational Oncology.2005(3)

[4]Human papillomavirus DNA in sera of cervical cancer patients as tumor marker[J].Andreas Widschwendter,Anya Blassnig,Annemarie Wiedemair,Elisabeth Müller-Holzner,Hannes M Müller,Christian Marth.Cancer Letters.2003(2)

[5]O-297 Quantification of free circulating DNA as a diagnostic marker in lung cancer[J].Gabriella Sozzi,Davide Conte,Maria Elena Leon,Rosalia Cirincione,Luca Roz,Elena Roz,Nicola Cirenei,Massimo Bellomi,Giuseppe Pelosi,Ugo Pastorino.Lung Cancer.2003

[6]Maternal serum cell-free fetal DNA levels are increased in cases of trisomy 13 but not trisomy 18[J].Tuangsit Wataganara,Erik S.LeShane,Antonio Farina,Geralyn M.Messerlian,Thomas Lee,Jacob A.Canick,Diana W.Bianchi.Human Genetics.2003(2)

[7]Cell-free DNA:measurement in various carcinomas and establishment of normal reference range[J].Tsu-Lan Wu,Diana Zhang,Ju-Hsin Chia,Kuo-Chien Tsao,Chien-Feng Sun,James T.Wu.Clinica Chimica Acta.2002(1)

[8]陳丹.人血液循環(huán)DNA的定量檢測研究[D].南京醫(yī)科大學(xué),2007.

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