背景及概述[1]
高通量基因編輯技術(shù)幫助人們實(shí)現(xiàn)了“編輯生命”的愿望,常規(guī)的基因編輯自身存在的局限性限制了其廣泛應(yīng)用,此前人們的研究熱情也多集中在編輯的效率、準(zhǔn)確性與安全性,但常規(guī)的基因編輯技術(shù)在一個(gè)反應(yīng)中僅能對(duì)一個(gè)或數(shù)個(gè)基因進(jìn)行操作,且通常會(huì)在基因組中留下額外的不需要的序列修改,在大型研究中,常規(guī)的基因編輯遠(yuǎn)遠(yuǎn)無法滿足大量不同基因的編輯需求。高通量基因編輯可以一次編輯數(shù)百種基因。
編輯方法[1]
哈佛大學(xué)George Church教授領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種基于CRISPR-Cas9的新型高通量基因編輯方法:guide+donor,該方法可以在單個(gè)釀酒酵母中同時(shí)精確改變數(shù)百個(gè)不同基因,編輯效率達(dá)到80%至100%,還能在生物體內(nèi)選擇特定行為細(xì)胞,進(jìn)行定向基因編輯和修復(fù)。guide+donor除幫助構(gòu)建大型文庫外,還能進(jìn)行基因功能分析,發(fā)現(xiàn)一些未知的基因突變和功能。Church表示,新的方法不僅能夠更高效、更準(zhǔn)確地在酵母中進(jìn)行高通量“功能基因組學(xué)”研究,還能模擬、檢測(cè)酵母細(xì)胞中與特定性狀或功能紊亂相關(guān)的低頻基因突變,并找出哪些與疾病實(shí)際相關(guān)。此外,該方法除了可以在龐大的基因家族中挖掘新的基因和功能外,還能研究基因組中的非編碼序列,提高我們對(duì)基因調(diào)控和染色體生物學(xué)的理解。技術(shù)優(yōu)勢(shì):在一個(gè)反應(yīng)中快速構(gòu)建大型DNA變異文庫;在一個(gè)反應(yīng)中同時(shí)提供guide和donor,防止無效修復(fù)和非生產(chǎn)性修復(fù);含有g(shù)uide+donor組合的質(zhì)粒可以作為追蹤基因編輯細(xì)胞的獨(dú)特條形碼,利用NGS技術(shù)可以進(jìn)行高通量分子表型鑒定。
主要參考資料
[1] High-throughput creation and functional profiling of DNA sequence variant libraries using CRISPR–Cas9 in yeast