背景[1-3]
化膿放線菌PCR試劑盒是一種用于檢測化膿放線菌的PCR試劑盒。該試劑盒包含多種引物和探針,可以同時擴(kuò)增和檢測多個化膿放線菌的基因序列,從而提高檢測的準(zhǔn)確性和靈敏度。
化膿放線菌PCR試劑盒利用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)技術(shù),對疑似化膿放線菌感染的樣本進(jìn)行快速、靈敏和特異的檢測。該試劑盒包含一系列必要的成分,如引物、酶、染料等,用于擴(kuò)增化膿放線菌的特異性基因片段,從而實(shí)現(xiàn)對目標(biāo)病原體的快速鑒定和檢測。
化膿放線菌PCR試劑盒的主要用途包括:
快速檢測:該試劑盒可以快速、準(zhǔn)確地檢測出化膿放線菌的存在,有助于臨床醫(yī)生及時診斷和治療。
高通量檢測:該試劑盒可以同時擴(kuò)增和檢測多個化膿放線菌的基因序列,適用于大規(guī)模樣本的檢測。
靈敏度高:該試劑盒具有較高的靈敏度,可以檢測到極低濃度的化膿放線菌DNA。
特異性強(qiáng):該試劑盒具有較強(qiáng)的特異性,可以區(qū)分不同的化膿放線菌種類。
總之,化膿放線菌PCR試劑盒是一種非常有用的工具,可以幫助臨床醫(yī)生快速、準(zhǔn)確地診斷和治療化膿放線菌感染。
化膿放線菌PCR試劑盒
化膿放線菌PCR試劑盒的操作步驟如下:
1.樣本采集:從患者體內(nèi)采集血液、糞便、組織等樣本,并將其保存在無菌容器中。
2.DNA提?。簩⒉杉降臉颖具M(jìn)行DNA提取,通常采用柱式或磁珠式DNA提取試劑盒。提取后的DNA應(yīng)保存在-20°C或更低的溫度下。
3.PCR反應(yīng)體系準(zhǔn)備:根據(jù)化膿放線菌PCR試劑盒說明書的要求,配制PCR反應(yīng)體系,包括引物、熒光探針、dNTPs、DNA聚合酶等。
4.PCR反應(yīng):將提取的DNA加入到PCR反應(yīng)體系中,進(jìn)行PCR反應(yīng)。反應(yīng)條件和時間根據(jù)試劑盒說明書的要求進(jìn)行設(shè)置。
5.結(jié)果分析:將PCR反應(yīng)后的產(chǎn)物進(jìn)行熒光信號檢測,根據(jù)熒光信號的出現(xiàn)情況判斷是否存在化膿放線菌的感染。
應(yīng)用[4-5]
化膿放線菌PCR試劑盒可以用于豬源化膿隱秘桿菌強(qiáng)、弱毒株全基因組測序及HSP100/Clp基因轉(zhuǎn)錄水平差異分析
化膿隱秘桿菌(Trueperella pyogenes)又名化膿放線菌或化膿棒狀桿菌?;撾[秘桿菌可通過侵染易感動物的黏膜和皮膚誘發(fā)化膿性炎癥,該菌也可與其他病原菌混合感染。建立的間接ELISA方法可用于調(diào)查豬群中化膿隱秘桿菌抗體情況,該方法可作為化膿隱秘桿菌抗體檢測的一種新手段。
本研究采用二代加三代測序技術(shù)分別對豬源化膿隱秘桿菌強(qiáng)、弱毒株進(jìn)行全基因組測序,完成了豬源化膿隱秘桿菌強(qiáng)毒株(TP-2849;NZCP029004.1)與弱毒株(TP4479;NZCP029001.1)的基因島預(yù)測、致病菌毒力因子預(yù)測、抗生素抗性基因預(yù)測、COG注釋、KEGG注釋、GO注釋與基因組圈圖的繪制,以上結(jié)果填補(bǔ)了豬源化膿隱秘桿菌全基因組的相關(guān)數(shù)據(jù)。Virulence Factors Database(VFDB)數(shù)據(jù)庫預(yù)測結(jié)果中發(fā)現(xiàn),豬源化膿隱秘桿菌強(qiáng)、弱毒株中均存在5種HSP100/Clp基因。本研究以豬源化膿隱秘桿菌強(qiáng)毒株TP-2849與弱毒株TP4479對BABL/c小鼠進(jìn)行攻毒試驗(yàn),以化膿放線菌PCR試劑盒實(shí)時熒光定量PCR檢測5種HSP100/Clp基因在BALB/c小鼠的7種臟器組織和血液中的表達(dá)量,結(jié)果顯示,豬源化膿隱秘桿菌強(qiáng)、弱毒株的5種HSP100/Clp基因表達(dá)量差異極顯著。繪制豬源化膿隱秘桿菌強(qiáng)、弱毒株生長曲線,化膿放線菌PCR試劑盒結(jié)果顯示,弱毒株的遲緩期長于強(qiáng)毒株;強(qiáng)毒株的穩(wěn)定期長于弱毒株的穩(wěn)定期。綜上所述,豬源化膿隱秘桿菌毒力的強(qiáng)弱及生長速率的快慢與5種HSP100/Clp基因轉(zhuǎn)錄水平表達(dá)量有著緊密的聯(lián)系。
參考文獻(xiàn)
[1]Replacing the 238th aspartic acid with an arginine impaired the oligomerization activity and inflammation-inducing property of pyolysin[J].Zhang;;Wang;;Wang;;Zhang;;Hu;;Ma;;Wang.Virulence,2018(1)
[2]A T4virus prevents biofilm formation by Trueperella pyogenes[J].Vinícius da Silva Duarte;;Roberto Sousa Dias;;Andrew M.Kropinski;;Andréda Silva Xavier;;Camila Geovana Ferro;;Pedro M.P.Vidigal;;Cynthia Canedo da Silva;;Sérgio Oliveira de Paula.Veterinary Microbiology,2018
[3]Trueperella pyogenes and Brucella abortus Coinfection in a Dog and a Cat on a Dairy Farm in Egypt with Recurrent Cases of Mastitis and Abortion[J].Gamal Wareth;;Mohamed El-Diasty;;Falk Melzer;;Jayaseelan Murugaiyan;;Amir Abdulmawjood;;Lisa D.Sprague;;Heinrich Neubauer;;Giuliano Bettini.Veterinary Medicine International,2018
[4]Virulence markers associated with Trueperella pyogenes infections in livestock and companion animals[J].R.M.Risseti;;E.Zastempowska;;M.Twaru?ek;;H.Lassa;;J.C.F.Pantoja;;A.P.C.de Vargas;;S.T.Guerra;;C.A.D.Bola?os;;C.L.de Paula;;A.C.Alves;;B.S.Colhado;;F.V.R.Portilho;;C.Tasca;;G.H.B.Lara;;M.G.Ribeiro.Letters in Applied Microbiology,2017(2)
[5]田佳琪.豬源化膿隱秘桿菌強(qiáng)、弱毒株全基因組測序及HSP100/Clp基因轉(zhuǎn)錄水平差異分析[D].吉林農(nóng)業(yè)大學(xué),2020.