DNA甲基化修飾試劑盒
產(chǎn)品及特點(diǎn)本產(chǎn)品是亞硫酸氫鹽 DNA 修飾試劑盒(CAT#:100922)的升級(jí)版,亞硫酸氫鹽修 飾 DNA 時(shí)要求 DNA 必須在單鏈狀態(tài),反應(yīng)還必須在低溫進(jìn)行,常規(guī)的修飾試劑盒由于 是在液相進(jìn)行,要在低溫下讓 DNA 不相互復(fù)性而保持單鏈狀態(tài)非常棘手,所以常規(guī)修飾 試劑盒的修飾效率一般都不高。此外,常規(guī)方法要切換反應(yīng)液,有多次沉淀步驟,使得 DNA 的回收率一般都不超過 50%。為克服這些缺點(diǎn),本公司開發(fā)出了此產(chǎn)品,它具有下 列特點(diǎn):
1.用包埋的樣品進(jìn)行所有操作,免去所有沉淀和純化步驟,極大簡(jiǎn)化了操作。
2.免去了 DNA 提取過程,所需實(shí)驗(yàn)材料比常規(guī)方法更少,最少幾個(gè)細(xì)胞都可以,極大 地節(jié)約了寶貴材料,尤其適用于珍稀材料。
3.包埋處理后,DNA 在整個(gè)操作過程中都處于最適于修飾的單鏈狀態(tài),提高了修飾效 率。
4.DNA 包埋于包埋塊中,切換反應(yīng)液非常方便,而且 DNA 不會(huì)丟失,所以最終回收率 都在 90%以上。
5.適用于實(shí)體材料、懸浮細(xì)胞和純化好的 DNA 樣品。
6.本試劑盒足夠制備 150 多個(gè)10uL 包埋塊(如果用純化好的 DNA)或 25 個(gè) 10uL 包埋塊(如果用懸浮細(xì)胞)。
DNA甲基化修飾試劑盒
規(guī)格及成分 成分 產(chǎn)品編號(hào) 小扁盒包裝(無墊)
甲基化修飾溶液 A 130301a 30 mL
包埋液 130301b 1.5 mL(藍(lán)蓋,低溫成分)
包埋塊裂解液 120655a 12.5 mL(低溫成分)
分子生物學(xué)級(jí)石蠟油 130306 25 mL
蛋白酶 K 溶液(10mg/mL) 80911 150 uL(紅蓋,低溫成分)
甲基化修飾溶液 B 成分一 100922b1 2.3 g×5(10mL ,棕色瓶)
甲基化修飾溶液 B 成分二 100922b2 110 mg×5(1.5mL 棕色管)
TE 緩沖液,pH 8.0 80934 125 mL
使用手冊(cè) 130301sc 1 份
自備試劑 超純水
DNA甲基化修飾試劑盒運(yùn)輸及保存 常溫運(yùn)輸及保存,蛋白酶 K 溶液、包埋液和包埋塊裂解液需低溫運(yùn)輸,-20℃保存。 有效期一年。
使用方法 一:準(zhǔn)備試劑
1. 在裝有 2.3g 甲基化修飾溶液 B(簡(jiǎn)稱溶液 B,下同)成分一干粉的瓶中加入 3.9 mL 水和 0.9 mL 甲基化修飾溶液 A(簡(jiǎn)稱溶液 A,下同),搖晃溶解得到 4.8 mL 溶液 B 成分一。
2. 在裝有 110mg 溶液 B 成分二干粉的離心管中加入 1 mL 50℃預(yù)熱的超純水,搖晃 溶解,得到溶液 B 成分二。
3. 將 0.6 mL 溶液 B 成分二加入到 4.8 mL 溶液 B 成分一中,得到 5.4 mL 溶液 B, 冰上放置待用。未用完的溶液 B 下次不得再使用。
4. 每次實(shí)驗(yàn)前,將裝有 1.5 mL 包埋液的離心管在沸水浴上放置數(shù)分鐘直到變成溶液, 然后放 80℃待用。
二、對(duì)微量組織材料(如果材料足夠,可先純化 DNA,再直接進(jìn)入第三步)
1. 用常規(guī)的胰酶消化法處理動(dòng)物實(shí)體組織或培養(yǎng)細(xì)胞,得到濃度不超過 60 個(gè)細(xì)胞/uL
的單細(xì)胞 PBS 懸液。如果實(shí)驗(yàn)材料已經(jīng)是單細(xì)胞懸浮液(如卵細(xì)胞),則 PBS 洗滌后直接離心沉淀,再重懸在 PBS 中(濃度不超過 60 個(gè)細(xì)胞/uL)。注:本試劑盒不
含本步所需相關(guān)試劑,如胰酶消化液和 PBS。
2. 在一個(gè)自備的 2 mL 離心管中加入 3 uL 上步所得細(xì)胞懸液,再迅速滴加 7 uL 在80℃預(yù)熱的包埋液。注:不需要吹打混勻以免混合液在搶頭里面凝固。
3. 加入 500 uL 分子生物學(xué)級(jí)石蠟油,短暫離心后將離心管在沸冰浴中放 20 分。
4. 將離心管轉(zhuǎn)移到冰上放置 30 分鐘,低溫下包埋液和細(xì)胞混合液將凝固成 10uL 的包埋塊,包埋塊中將包含細(xì)胞的基因組 DNA 和蛋白質(zhì)組份。
5. 在包埋塊中加入 500 uL 包埋塊裂解液和 5 uL 蛋白酶 K 溶液(10mg/mL),短暫離心后 37℃保溫過夜,降解其中的蛋白質(zhì)組份。
6. 吸棄包埋塊之外的所有溶液(包括石蠟油),用 1mL TE 緩沖液室溫浸泡包埋塊 2 次,每次 15 分鐘。此步可去除殘留包埋塊裂解液和殘留的蛋白酶 K。
7. 酶切包埋塊中的基因組 DNA:選定不識(shí)別 PCR 靶片段的內(nèi)切酶(本試劑不提供該相關(guān)試劑),再用 100 uL 選定內(nèi)切酶的 1×緩沖室溫液浸泡包埋塊 15 分鐘,吸棄緩沖液后再加入 100 uL 選定內(nèi)切酶的 1×緩沖液和 50U 內(nèi)切酶,37℃保溫 2 小時(shí)。
8. 吸棄內(nèi)切酶反應(yīng)液,再加入 500 uL 新鮮配制的處理液 A(配制方法:100 uL 溶液A+400 uL 超純水)室溫放置 15 分鐘,重復(fù)此步一次。此時(shí) DNA 將呈單鏈。
9. 吸棄處理液 A 后,用 1 mL 新鮮配制的處理液 B(注:不是溶液 B,配制方法:50uL溶液 A+950 uL 超純水)室溫浸泡包埋塊 5 分鐘。
10.吸棄處理液 B 后,加入 750uL 石蠟油,然后沸水浴 20-30 秒,使 DNA 單鏈徹底彼此分開。
11.將離心管轉(zhuǎn)移到冰上放置 30 分鐘使包埋塊重新凝固,單鏈 DNA 將固化。
12.在離心管中加入 1mL 預(yù)冷的溶液 B,短暫離心后繼續(xù)在冰上放置 30 分鐘。此步用于修飾固化的單鏈 DNA。
13.將離心管轉(zhuǎn)移到 50℃放置 3.5 小時(shí)。
14.吸棄溶液 B,用 1mL TE 緩沖液常溫洗滌包埋塊 2 次,每次 15 分鐘。
15.吸棄 TE 緩沖液,用 500 uL 新鮮配制的處理液 C(50 uL 溶液 A+450 uL 超純水)常溫洗滌包埋塊 2 次,每次 15 分鐘。
16.吸棄處理液 C,用 1 mL TE 緩沖液常溫洗滌包埋塊 3 次,每次 10 分鐘.
17.吸棄 TE 緩沖液,所得包埋塊可以在 4℃保存數(shù)月待用,也可以用超純水洗滌兩次(每次 15 分鐘)后直接用做 100uL 體系甲基化 PCR 的模板。
三、對(duì)純化好的 DNA
18. 如果是純化好的 DNA,直接選用不識(shí)別 PCR 靶片段的合適內(nèi)切酶酶切純化的DNA(本試劑不提供所需試劑),總體積不超過 20uL,DNA 不超過 700 ng。
19. 酶切結(jié)束后,沸水浴 5-10 分鐘滅活內(nèi)切酶并變性 DNA。
20. 冰上放置并短暫離心數(shù)秒后,再加入 4 uL 溶液 A,50℃保溫 15 分鐘。
21. 迅速加入 50 uL 在 80℃預(yù)熱的包埋液,用手指快速?gòu)棑艄艿谆靹蛉芤翰⒗^續(xù)放80℃待用。不要吹打混勻以避免包埋液在移液槍頭中凝固。
22. 在一個(gè)新的 2 mL 離心管中,加入 1 mL 預(yù)冷的溶液 B,再加上 750 uL 石蠟油,短暫離心后將離心管放冰上預(yù)冷。
23. 迅速取 80℃保溫的混合液 10uL(第 21 步),用在空中滴加的方式加到第 22 步準(zhǔn)備的預(yù)冷離心管中,滴加的混合液遇冷將迅速在石蠟油中形成一個(gè)包埋塊。注意:不要將槍頭浸入到預(yù)冷的溶液中,否則包埋液將迅速在槍頭內(nèi)凝固。如果包埋塊沒有沉到管底,可以用槍頭將其撥到石蠟層下面的液相中。
24. 再重復(fù)上步操作 6 次(步驟 23),共可以得到 7 個(gè)包埋塊(約含 100ng DNA)。
25. 將離心管(含 7 個(gè)包埋塊)繼續(xù)放冰上 30 分鐘進(jìn)行修飾。
26. 后續(xù)操作同第 13-17 步。
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上海康朗生物科技有限公司是一家集研發(fā)、生產(chǎn)、銷售、服務(wù)于一體的一家生物科技企業(yè),專營(yíng)生化試劑、標(biāo)準(zhǔn)品、基因、蛋白、抗體、Elisa試劑盒、細(xì)胞生物學(xué),分子生物學(xué)等高生物產(chǎn)品??偛课挥谏虾?,并在北京、廣東,江西,吉林等全國(guó)30多個(gè)省市設(shè)有分公司和代理機(jī)構(gòu)。涉及的產(chǎn)品被中國(guó)科學(xué)院、清華、北大、復(fù)旦,上海交大,復(fù)旦醫(yī)學(xué)院,上海中醫(yī)藥大學(xué),華東師范大學(xué),第二軍醫(yī)大學(xué),曙光醫(yī)院,浦東新區(qū)人民醫(yī)院等知名科研院所廣泛使用,可靠而穩(wěn)定的質(zhì)量和完善的售后服務(wù)確。