Cy5.5 (Cyanine 5.5) 是一種發(fā)近紅外（NIR）熒光的花青素?zé)晒馊玖稀Ｋ南庀禂?shù)高，熒光也很亮，并且對(duì)pH不敏感，并且由于它的熒光波長(zhǎng)（Em：~700nm）恰好處于肌體組織近紅外窗口 I 的區(qū)域（肌體的血液，體液和組織此區(qū)域背景熒光弱，而長(zhǎng)波長(zhǎng)穿透性強(qiáng)），所以Cy5.5常應(yīng)用于小動(dòng)物活體體內(nèi)成像中。 Cy5.5可以用來(lái)標(biāo)記蛋白，抗體，多肽，納米粒等，它最常見(jiàn)的使用是標(biāo)記核酸分子（DNA和RNA）。

NHS活化酯（N-羥基琥珀酰亞胺酯，N-hydroxysuccinimide ester（NHS），succinimidyl ester（SE））是生物標(biāo)記反應(yīng)中最常用的活化基團(tuán)。它活化Cy5.5分子中的羧基，讓它可以和目標(biāo)生物分子上的胺基（主要伯胺）反應(yīng)生成穩(wěn)定的酰胺鍵，從而把Cy5.5分子標(biāo)記到生物大分子上。由于游離胺基是蛋白，抗體，多肽表面的常見(jiàn)官能團(tuán)（來(lái)自于賴胺酸側(cè)鏈），Cy5.5-NHS可以和它們直接反應(yīng)。核酸分子中天然不帶游離胺基，只有胺基修飾過(guò)的RNA或者DNA才可以和Cy5-NHS反應(yīng)。

Cy5.5-NHS活化酯的水溶性較低，所以在水相的標(biāo)記反應(yīng)體系內(nèi)需要使用有機(jī)共溶劑，常用有機(jī)溶劑包括DMF，DMSO和乙腈等。如需標(biāo)記的分子對(duì)有機(jī)溶劑敏感，可選擇磺化花青素（sulfonated cyanine），即sulfo-Cy5.5-NHS活化酯。兩者的光譜性質(zhì)幾乎一致，因此大部分應(yīng)用可相互替換。兩者的主要區(qū)別在于：磺化染料是水溶性的，在水相的標(biāo)記反應(yīng)體系內(nèi)不需要使用有機(jī)共溶劑，并且降低染料在水中聚集的可能性，增強(qiáng)標(biāo)記效率。