在進(jìn)行核酸提取時(shí),不只是依靠試劑盒中的裂解液和緩沖液,常常還需要使用到其他的組分來提高提取效率和核酸的質(zhì)量。本文將帶您深入了解兩種關(guān)鍵的輔助酶——核糖核酸酶A和蛋白酶K,探索它們?cè)诤怂峒兓胁豢苫蛉钡淖饔谩?/span>

切割的藝術(shù)—核糖核酸酶A
核糖核酸酶A不僅僅是一種酶,它是確保DNA純凈無瑕的關(guān)鍵——可以特異性地攻擊RNA上嘧啶殘基的3'端,切割與相鄰核苷酸形成的磷酸二酯鍵。這種酶的存在幫助科研人員在提取DNA時(shí),清除可能混入的RNA雜質(zhì)。想象一下,在沒有這種精準(zhǔn)的“切割工”時(shí),我們可能無法獲得用于PCR或測(cè)序等關(guān)鍵實(shí)驗(yàn)的高質(zhì)量DNA。

RNase A應(yīng)用:
√ 去除DNA或蛋白質(zhì)樣品的RNA污染,如基因組DNA/質(zhì)粒提?。?/span>
√ 為DNA純化提供支持;
√ RNA檢測(cè)- RNA酶保護(hù)分析法中應(yīng)用;

RNase A 對(duì)RNA有水解作用,對(duì)DNA無影響,DNA提取實(shí)驗(yàn)中搭配RNase A有助于提高DNA純度; RNase A 作用于單鏈RNA時(shí),效率高。推薦工作濃度為10-20μg/mL,兼容于多種反應(yīng)體系。
金普諾安自主研發(fā)生產(chǎn)的核糖核酸酶A(Ribonuclease A)是經(jīng)過蛋白質(zhì)工程技術(shù)改造的源于牛胰腺(bovine pancreas)的非特異性核糖核酸內(nèi)切酶,經(jīng)過酵母表達(dá)、純化獲得。它不含有原核生物表達(dá)的細(xì)菌內(nèi)毒素。

蛋白酶K:更多的不只是消化
蛋白酶K (Proteinase K)是一種廣譜型絲氨酸蛋白酶,能在各種條件下穩(wěn)定工作,特別是在含一定濃度SDS、尿素等變性環(huán)境中,依然保持較高酶活力。當(dāng)面對(duì)那些堅(jiān)硬的細(xì)胞壁或是蛋白質(zhì)豐富的樣本時(shí),蛋白酶K展現(xiàn)了它的強(qiáng)大力量。它不只是簡單地消化蛋白質(zhì),蛋白酶K在不損害分離DNA完整性的前提下水解肽鍵來降解蛋白質(zhì),釋放出被困的核酸,為純化過程掃清障礙。

生化領(lǐng)域的應(yīng)用:
√ 去除核酸酶和其它蛋白污染:應(yīng)用于基因診斷試劑盒、基因組DNA提取試劑盒、RNA提取試劑盒中。
√ 簡化PCR樣本準(zhǔn)備:在直擴(kuò)PCR實(shí)驗(yàn)中用于生物樣本的初步處理,簡化實(shí)驗(yàn)步驟。
√ 病毒核酸檢測(cè):在處理病毒樣本時(shí),蛋白酶K能夠裂解病毒外殼,暴露其核酸,便于后續(xù)的檢測(cè)。
√ 生物制藥工業(yè):提取核酸、多糖類藥物等非蛋白類生物制品,例如DNA疫苗和肝素的制備。

在使用蛋白酶K時(shí),需確保反應(yīng)緩沖液的pH和溫度適宜,以維持酶的活性。過高的溫度或不適宜的pH值可能導(dǎo)致酶活性下降。同時(shí)蛋白酶K的濃度過高會(huì)對(duì)細(xì)胞的結(jié)構(gòu)有一定的破壞,若濃度過低,則就會(huì)影響蛋白質(zhì)的水解程度導(dǎo)致提取效果受到影響。
金普諾安蛋白酶K來源于表達(dá)經(jīng)過定點(diǎn)突變優(yōu)化的林伯氏白色念球菌(Engyodontium album)蛋白酶K基因的畢赤酵母,具有比活性高、產(chǎn)量高及更廣的溫度/pH值活性范圍等優(yōu)勢(shì)。先進(jìn)的蛋白質(zhì)工程技術(shù)及28,000升酵母平臺(tái)有效單位成本,為生物醫(yī)藥研發(fā)與生產(chǎn)提供高性價(jià)比的蛋白酶K。酵母高效表達(dá)和色譜純化保證了產(chǎn)品的純度,本產(chǎn)品不含細(xì)菌內(nèi)毒素,應(yīng)用范圍比天然蛋白酶K更廣泛。

結(jié)語:蛋白酶K和RNase A是核酸提取中不可或缺的輔助工具。它們各自具有獨(dú)特的作用和應(yīng)用范圍,正確的使用可以大大提高實(shí)驗(yàn)的效率和核酸的質(zhì)量。在實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和操作時(shí),應(yīng)注意各種條件和參數(shù),以充分發(fā)揮這些輔助酶的作用。
——文章插圖來源于攝圖網(wǎng),已獲授權(quán)