利用水和酯能共沸但不互溶，且水的密度較大，冷凝后水層下沉的性質，來方便分出水和酯，分水器通過不斷分出水相促使反應向正方向進行。

在常用化學實驗中，例如溶解溶液或過濾懸浮液，分水器可以起到分離固體顆粒和液體的作用。它也可以用于將混合物分離成其原始成分，同時保持不同物質的純凈性。對于液滴狀物質的實驗，分水器也可以用于將液滴狀物質收集和分離。