葉綠素是植物光合作用色素，主要有 chla chlb ， 不溶于水 ,可溶于酒精.丙酮和石油醚。葉綠素是葉綠酸的酯，葉綠酸是雙羧酸，其中一個羧基被甲醇酯化，另一個被葉醇酯化，能發(fā)生皂化反應(yīng)。葉綠素 分子含有一個卟啉環(huán)的“頭部”和一個葉綠醇 ( 植醇， phytol) 的“尾巴”。卟啉環(huán)中的鎂原子可被 H ＋、 Cu2 ＋、 Zn2 ＋所置換。用酸處理葉片， H ＋易進(jìn)入葉綠體，置換鎂原子形成去鎂葉綠素，使葉片呈褐色。去鎂葉綠素易再與銅離子結(jié)合，形成銅代葉綠素，顏色比原來更穩(wěn)定。人們常根據(jù)這一原理用醋酸銅處理來保存綠色植物標(biāo)本。
葉綠素儀可以獲得同其它用于活體檢測環(huán)境中葉綠素檢測的商品化熒光計(jì)相同的準(zhǔn)確度。如果用戶根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)方法收集水樣，進(jìn)行細(xì)胞破碎，用分光光度法或HPLC對萃取的葉綠素進(jìn)行測定，測量結(jié)果的準(zhǔn)確度將會好于使用便攜式葉綠素儀進(jìn)行的測量。? 活體測定的相對準(zhǔn)確度將會完全取決于用戶使用的校準(zhǔn)方法（見下一問題）。無論使用了哪一種校準(zhǔn)方法，葉綠素儀的讀數(shù)將會近似地追蹤被分析的環(huán)境水樣中的葉綠素變化趨勢。例如，如果用戶使用傳感器，并以一個標(biāo)準(zhǔn)的采樣間隔（15分鐘）為間隔讀取讀數(shù)，葉綠素?cái)?shù)據(jù)的變化 通常反映出一段比較長的時(shí)間內(nèi)，該地點(diǎn)浮游植物的增加或減少。如果用戶對相同水體的數(shù)據(jù)點(diǎn)進(jìn)行水平或垂直繪圖，那么傳感器輸入通常將會顯示出在不同采樣地點(diǎn)浮游植物存在的多或少。以下的圖表示了在不同地點(diǎn)用和一臺高品質(zhì)單參數(shù)商品化熒光計(jì)的葉綠素變化曲線。
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