微生物在地球上已經(jīng)存在了至少38億年,幾乎遍及生物圈的各個角落,微生物代謝能力和代謝形式的多樣性是地球上的其他生物無法比擬的。微生物基因組較小,基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白組學(xué)得到的數(shù)據(jù)相比真核生物來說相對較少,代謝組的研究則不會受此影響(已闡明的的微生物代謝物大概有20000種),可以全面理解微生物生理功能;這些因素使得代謝組學(xué)在微生物研究中具有自己獨特的優(yōu)勢。代謝組學(xué)作為功能基因組學(xué)研究技術(shù)家族的新成員,借助微生物細(xì)胞代謝物全組分分析用以反應(yīng)細(xì)胞對環(huán)境和基因變化的反應(yīng);由于代謝組學(xué)更接近于細(xì)胞功能的反映,所以代謝組學(xué)技術(shù)被認(rèn)為是研究微生物細(xì)胞功能良好的手段。此外,微生物體積微小、結(jié)構(gòu)簡單、培養(yǎng)條件相對容易滿足、多數(shù)微生物可以在較短的時間內(nèi)獲得大量培養(yǎng)物、很容易將代謝過程與細(xì)胞功能或者表型相聯(lián)系;代謝組學(xué)得來的數(shù)據(jù)明顯不同于從基因組學(xué)(可能發(fā)生的)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)(可以發(fā)生的)和蛋白質(zhì)組學(xué)(賴以發(fā)生的)所得到的數(shù)據(jù),而是反映了細(xì)胞-已經(jīng)發(fā)生的情況; 百泰派克提供微生物代謝組學(xué)一站式服務(wù),您只需要將您的實驗?zāi)康暮蛯嶒灅悠芳慕o我們,我們將負(fù)責(zé)后續(xù)所有的實驗;百泰派克采用Thermo公司的Q Exactive和AB公司的Q TOF 5600兩類質(zhì)譜儀建立了分別針對于微生物初生代謝物和次生代謝物的代謝組學(xué)研究平臺,根據(jù)您的實驗?zāi)康牟捎貌煌臉悠诽幚矸桨阜謩e高效提取微生物代謝物進(jìn)行分析,在有效回答您生物學(xué)問題的同時提高了代謝物鑒定和定量數(shù)量和準(zhǔn)確性。
為了從整體上分析代謝物,樣品提取方法應(yīng)該滿足下幾個要求: 盡可能多的提取代謝物;無偏向性;不破壞或改變代謝物的物理或化學(xué)特性。 在實際實驗過程中,我們會對您的實驗樣品進(jìn)行預(yù)實驗。預(yù)實驗過程中,我們會用多種不同的代謝分子萃取方式,并對每一種萃取方式得到的樣品進(jìn)行質(zhì)譜的分析;不同萃取方法得到的樣品進(jìn)行質(zhì)譜分析之后得到的原始數(shù)據(jù)進(jìn)行深度的生物信息學(xué)分析,通過鑒定得到的代謝分子與您感興趣的代謝分子進(jìn)行匹配,基于此匹配的結(jié)果選擇合適的一到兩種萃取方法進(jìn)行后續(xù)正式批量樣品的處理和分析。
在技術(shù)報告中,百泰會為您提供詳細(xì)的中/英文雙語版技術(shù)報告,報告包括: 1. 實驗步驟(中英文) 2. 相關(guān)的質(zhì)譜參數(shù)(中英文) 3. 質(zhì)譜圖片 4. 原始數(shù)據(jù) 5. 代謝組學(xué)分析結(jié)果
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