人基因開放閱讀框(ORF)庫制備
信裕生物的人基因開放閱讀框(ORF)庫(Human Open Reading Frame library)包含約15,000個人基因ORF克隆,其中包括已知的基因約12,000種。本人基因ORF庫的每一種質粒都來自于單克隆,并且每一個ORF都經過了測序驗證。后續(xù)使用Gateway系統(tǒng)或PCR反應即可非常方便地克隆目的基因到新的表達載體中。 本人基因ORF庫的克隆在供體載體(Donor vector) pDONR223中,其圖譜如圖1所示。
圖1. pDONR223質粒圖譜。 pDONR223的全序列信息:pDONR223-seq.txt。
ORF克隆是指起始密碼子和終止密碼子之間的編碼序列,而不包含mRNA的5’和3’端的非編碼區(qū)(untranslated region, UTR)。本ORF庫是通過mRNA反轉錄獲得的編碼蛋白質的cDNA,再通過Gateway技術的BP重組反應克隆到pDONR223載體中得到入門載體,其重組位點的序列如圖2所示。為了便于后續(xù)利用Gateway系統(tǒng)添加適當?shù)?’標簽,所有的克隆都無終止密碼子。在信裕生物的人基因ORF庫中,每一個克隆都代表一個獨立的插入序列,隨機挑取克隆測序,準確率為95%,但較長基因克隆準確率略差。
圖2. ORF兩側的重組序列
信裕生物的人基因ORF庫提供的是含有相應ORF質粒的大腸桿菌甘油菌(DH5α),本產品一套共169 塊96孔板。克隆載體為 pDONR223,載體抗性spectinomycin,推薦使用終濃度為50μg/ml。正向測序M13F引物序列為GTAAAACGACGGCCAGT,反向測序T7引物序列為TAATACGACTCACTATAGG。 人基因開放閱讀框(ORF)庫基因清單請點擊下載。 包裝清單:
信裕生物的人基因ORF庫提供的是含有相應ORF質粒的大腸桿菌甘油菌(DH5α),本產品一套共169 塊96孔板??寺≥d體為 pDONR223,載體抗性spectinomycin,推薦使用終濃度為50μg/ml。正向測序M13F引物序列為GTAAAACGACGGCCAGT,反向測序T7引物序列為TAATACGACTCACTATAGG。 人基因開放閱讀框(ORF)庫基因清單請點擊下載。 包裝清單:
保存條件: -20℃保存,二年有效。-80℃保存,五年有效。 注意事項: pDONR223載體不能直接在細菌或哺乳動物細胞中表達相應蛋白,需要重新克隆至相應表達載體才能表達。 本產品僅限于專業(yè)人員的科學研究用,不得用于臨床診斷或治療,不得用于食品或藥品,不得存放于普通住宅內。 為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作。使用說明: 1. 根據(jù)所需人基因ORF的名稱,查詢并選取相應的96孔板及孔進行菌種的接種培養(yǎng)。 a. 劃平板隨后挑取單克隆培養(yǎng):取出對應的96孔板置于冰上,并在超凈臺內進行后續(xù)操作。等菌液稍融化,撕開封口膜,并小心揭開96孔板板蓋,注意不要交叉污染。按照如下方法之一劃平板接種,隨后挑取單克隆接種到含抗生素的LB中培養(yǎng)。 (a) 用鑷子和塑料槍頭操作:鑷子的頂端在70%酒精中蘸一下,并且在酒精燈上略略燒一下,使鑷子的頂端處于無菌狀態(tài)。用鑷子夾取一個無菌的200微升塑料槍頭,蘸取少量DH5α甘油菌,然后把蘸有菌液的塑料槍頭,以盡量和LB平板接近平行的角度,在含50μg/ml spectin omycin的LB平板上連續(xù)作S形或Z形劃動,再用一無菌的200微升塑料槍頭,在原先的劃線上以90或120度角,再在LB平板上連續(xù)作S形或Z形劃動。通常換槍頭重復操作2-3次即可。37℃倒置培養(yǎng)過夜。 (b) 用接種環(huán)操作:將接種環(huán)在酒精燈上略略燒一下,使接種環(huán)處于無菌狀態(tài)。微冷后,蘸取少量DH5α甘油菌,在含50μg/ml spectinomycin LB平板上連續(xù)作S形或Z形劃動。把接種環(huán)再燒一下,微冷后,在原先的劃線上以90或120度角,再在LB平板上連續(xù)作S形或Z形劃動。通常用接種環(huán)重復操作2-3次即可。37℃倒置培養(yǎng)過夜。 b. 直接培養(yǎng):取出對應的96孔板置于冰上,并置于超凈臺內,后續(xù)操作都在超凈臺內操作。把鑷子的頂端在70%酒精中蘸一下,并且在酒精燈上略略燒一下,使鑷子的頂端處于無菌狀態(tài)。用鑷子夾取一個無菌的塑料槍頭或牙簽,蘸取少量DH5α甘油菌,然后把蘸有菌液的塑料槍頭或牙簽放到裝有3毫升含50μg/ml spectinomycin 的LB細菌培養(yǎng)試管內或裝有100毫升或更大體積LB的細菌培養(yǎng)瓶內。37℃,約200rpm培養(yǎng)過夜。 2. 對于培養(yǎng)的菌液進行質粒的小量、中量或大量抽提。 3. 重組或PCR克?。喝嘶騉RF庫的每一個蛋白質編碼序列兩端有特異的重組序列。通過LR重組反應可以將ORF轉移到特定接收載體中,例如Gateway系統(tǒng)的pDEST系列載體等,從而使目的基因在大腸桿菌、酵母、昆蟲細胞或哺乳細胞等中表達;也可以此ORF庫作為模板用PCR或其它常規(guī)方法克隆到其它蛋白表達載體中用于在細菌、酵母、昆蟲細胞或哺乳動物細胞等中的表達
保存條件: -20℃保存,二年有效。-80℃保存,五年有效。 注意事項: pDONR223載體不能直接在細菌或哺乳動物細胞中表達相應蛋白,需要重新克隆至相應表達載體才能表達。 本產品僅限于專業(yè)人員的科學研究用,不得用于臨床診斷或治療,不得用于食品或藥品,不得存放于普通住宅內。 為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作。使用說明: 1. 根據(jù)所需人基因ORF的名稱,查詢并選取相應的96孔板及孔進行菌種的接種培養(yǎng)。 a. 劃平板隨后挑取單克隆培養(yǎng):取出對應的96孔板置于冰上,并在超凈臺內進行后續(xù)操作。等菌液稍融化,撕開封口膜,并小心揭開96孔板板蓋,注意不要交叉污染。按照如下方法之一劃平板接種,隨后挑取單克隆接種到含抗生素的LB中培養(yǎng)。 (a) 用鑷子和塑料槍頭操作:鑷子的頂端在70%酒精中蘸一下,并且在酒精燈上略略燒一下,使鑷子的頂端處于無菌狀態(tài)。用鑷子夾取一個無菌的200微升塑料槍頭,蘸取少量DH5α甘油菌,然后把蘸有菌液的塑料槍頭,以盡量和LB平板接近平行的角度,在含50μg/ml spectin omycin的LB平板上連續(xù)作S形或Z形劃動,再用一無菌的200微升塑料槍頭,在原先的劃線上以90或120度角,再在LB平板上連續(xù)作S形或Z形劃動。通常換槍頭重復操作2-3次即可。37℃倒置培養(yǎng)過夜。 (b) 用接種環(huán)操作:將接種環(huán)在酒精燈上略略燒一下,使接種環(huán)處于無菌狀態(tài)。微冷后,蘸取少量DH5α甘油菌,在含50μg/ml spectinomycin LB平板上連續(xù)作S形或Z形劃動。把接種環(huán)再燒一下,微冷后,在原先的劃線上以90或120度角,再在LB平板上連續(xù)作S形或Z形劃動。通常用接種環(huán)重復操作2-3次即可。37℃倒置培養(yǎng)過夜。 b. 直接培養(yǎng):取出對應的96孔板置于冰上,并置于超凈臺內,后續(xù)操作都在超凈臺內操作。把鑷子的頂端在70%酒精中蘸一下,并且在酒精燈上略略燒一下,使鑷子的頂端處于無菌狀態(tài)。用鑷子夾取一個無菌的塑料槍頭或牙簽,蘸取少量DH5α甘油菌,然后把蘸有菌液的塑料槍頭或牙簽放到裝有3毫升含50μg/ml spectinomycin 的LB細菌培養(yǎng)試管內或裝有100毫升或更大體積LB的細菌培養(yǎng)瓶內。37℃,約200rpm培養(yǎng)過夜。 2. 對于培養(yǎng)的菌液進行質粒的小量、中量或大量抽提。 3. 重組或PCR克隆:人基因ORF庫的每一個蛋白質編碼序列兩端有特異的重組序列。通過LR重組反應可以將ORF轉移到特定接收載體中,例如Gateway系統(tǒng)的pDEST系列載體等,從而使目的基因在大腸桿菌、酵母、昆蟲細胞或哺乳細胞等中表達;也可以此ORF庫作為模板用PCR或其它常規(guī)方法克隆到其它蛋白表達載體中用于在細菌、酵母、昆蟲細胞或哺乳動物細胞等中的表達
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