DNA磷酸化試劑盒
產品及特點 人工合成的 PCR 引物、linker 和 adaptor 的 5′端一般都是-OH 基團而不是-PO4 基團(除非額外付費要求在人工合成時加上-PO4 基團),而任何 DNA 連接酶都不能將一個 DNA 分子 5′端的-OH 基團和另一個 DNA 分子 3′端的-OH 基團進行連接,因此通過人工合成的 DNA 片段和天然 DNA 之間的連接效率一般都比天然 DNA 彼此的連接效率低(天然 DNA 4 個端口均可連接,人工合成的 DNA 跟天然 DNA 有 2 個端口可以連接,人工合成的 DNA 之間沒有任何端口可以連接),尤其是在平末端連接時。本公司開發(fā)的 DNA 磷酸化產品能將 DNA 分子 5′端的-OH基團磷酸化。它具有下列特點:
1. 可以快速把 DNA 5′端的-OH 基團變成-PO4 基團,使人工合成的 DNA(包括PCR 產物)跟天然 DNA 一樣有高的連接效率。
2. 既可以對單鏈 DNA 進行磷酸化處理,也可以對雙鏈 DNA 片段同時磷酸化處理。
3. 處理后的 DNA 可以直接用于連接反應、克隆等,不需要純化。
4. 本產品足夠 20 次 DNA 的磷酸化實驗。
運輸及保存 低溫運輸,-20℃保存,有效期為 6 個月。
自備試劑 引物、PCR 產物、DNA 片段
使用方法
一:雙鏈 DNA 片段(5’端為-OH 基團的)的磷酸化
注意:如果是 PCR 產物,一定要先膠回收,不能使用沒經(jīng)過純化的 PCR 反應液,因為其中的殘留 PCR 引物會耗掉大量的激酶,降低 PCR 產物的磷酸化效率。
1、在微量離心管中配制下列反應液(20μL):成 分 用 量
PCR 膠回收片段 2 μL(不超過 10 pmol)
10×TPK 緩沖液 2 μL
ATP 溶液(10 mM) 5 μL
T4 多核苷酸激酶(10U/uL) 1 μL
超純水到 20 μL
2、37℃反應 30 分鐘。
3、70℃熱處理 5 分鐘,滅活酶。
4、可直接用于后續(xù)克?。尤肓坎灰^總體積的 1/5)。
二:單鏈 DNA 片段的磷酸化
注:單鏈 DNA 包括局部雙鏈的 DNA。引物,linker,adaptor,Oligo 探針等均按此操作處理。
5、在微量離心管中配制下列反應液(20μL):成 分 用 量
單鏈 DNA 片段 5-10 pmol
10×TPK 緩沖液 2 μL
ATP 溶液(10 mM) 1 μL
T4 多核苷酸激酶(10U/uL) 1 μL
超純水到 20 μL
6、37℃反應 30 分鐘。
7、70℃熱處理 5 分鐘,滅活激酶。
8、可直接用于后續(xù)克?。尤肓坎灰^總體積的 1/5)。如果使用濃度高,則可能需要乙醇沉淀法濃縮 DNA。如果單鏈 DNA 的濃度低于 5pmol,還需要在乙醇沉淀時加入核酸助沉劑。沉淀得到的 DNA 可溶解在適量的水中。附:乙醇沉淀濃度 DNA(本試劑盒不提供相關試劑,下列操作僅供參考_:
1、在 DNA 溶液中加入 0.1 倍體積的 3 M 乙酸鈉溶液(pH 5.2),
2、再加入 2.5 倍體積的無水乙醇和 4uL 核酸助沉劑。
3、混勻后 12000g 4℃離心 10 分鐘,小心棄上清。
4、加入 1mL 70%乙醇,短暫離心 3 分鐘后小心棄上清。
5、短暫離心 5 秒,吸棄殘留液體(約 30-50uL)。
6、室溫放置 2 分鐘干燥后加入適量的超純水溶解 DNA,立即使用或放-20℃長期保存。
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