超級(jí)雜交液(含甲酰胺)
產(chǎn)品及特點(diǎn) 核酸雜交一般是指用一種標(biāo)記的核酸探針與印跡膜上的核酸進(jìn)行雜交,由此檢測(cè)印跡膜上是否存在與探針同源的核酸分子(靶分子)。核酸雜交是分子生物學(xué)的基本技術(shù)之一,應(yīng)用非常廣泛。由于核酸雜交效率受印跡膜種類、雜交溫度、探針濃度、雜交液離子強(qiáng)度、雜交液 pH 及雜交液粘度等因素影響,用戶自己摸索和優(yōu)化相關(guān)條件非常繁瑣,因此本公司開發(fā)了本產(chǎn)品,它具有下列特點(diǎn):
1. 既可用于 Southern 雜交(靶分子為 DNA),也可用于和 Northern 雜交(靶分子為 RNA),還可以用于菌落雜交,基因芯片等雜交。
2. 既可以用于同位素探針的雜交,也可以用于非同位素探針的雜交。
3. 既可以使用 DNA(包括 DNA Oligo)探針,也可以使用 RNA 探針(包括 RNA Oligo)
4. 含多種能夠促進(jìn)雜交的聚合物,使雜交反應(yīng)能在 6~12 小時(shí)完成,而常規(guī)雜交反應(yīng)一般需要 12~24 小時(shí)。
5. 含多種封堵劑,能阻印跡膜對(duì)探針分子的非特異性吸附,能有效降低背景信號(hào),延長(zhǎng)曝光時(shí)間以便檢測(cè)到低拷貝的 RNA(Northern)和單拷貝的基因(Southern)。
6. A 型不含甲酰胺,B 型含 50%的甲酰胺。后者使雜交在較低溫度就可以完成,適合 Tm 較高的分子雜交(如 RNA-RNA 和 RNA-DNA 雜交)。
7. 跟各種常用的印跡膜兼容,包括硝酸纖維素膜和尼龍膜。
超級(jí)雜交液(含甲酰胺)運(yùn)輸及保存 低溫運(yùn)輸,-20℃保存,有效期一年。本產(chǎn)品屬于高鹽溶液,低溫下產(chǎn)生沉淀,必須在 65℃加熱溶解并充分搖勻后才能使用。
自備試劑 印跡膜、標(biāo)記探針、6×SSC、2×SSC、0.1×SSC
使用方法 一、根據(jù)探針和靶分子的不同,分別按下面不同情況計(jì)算雜交分子的 Tm 值
1. 對(duì) DNA-DNA 雜交,其 Tm = 81.5 + 16.6×log10[Na+] + 0.41×GC%–500/L
說明:L 是探針或靶分子的長(zhǎng)度(用兩者中最短的一個(gè))GC%是探針或靶分子中的 GC 百分比(用兩者中最短的一個(gè))Na+濃 度 是 本 產(chǎn) 品 中 Na+ 的 濃 度 , 為 0.75 M, 16.6×log10[Na+]=(-2.07)
2. 對(duì) DNA-RNA 雜交,其 Tm 值比 DNA-DNA 的 Tm 值要高 10-15℃。
3. 對(duì) RNA-RNA 雜交,其 Tm 值比 DNA-DNA 的 Tm 值要高 20-25℃。
4. 對(duì) Oligo 探針雜交,Tm=GC 數(shù)量×4℃+AT 數(shù)量×2℃。
二、確定雜交溫度(預(yù)雜交溫度跟雜交溫度應(yīng)該一樣)
1. 對(duì)于大于 200bp 的 DNA-DNA 雜交,雜交溫度一般比 Tm 低15-25℃,一般選擇 68℃。
2. 對(duì) RNA-RNA 或 DNA-RNA 雜交,雜交溫度一般比 Tm 低15-25℃。如果這樣計(jì)算出的雜交溫度很高(如高于 70℃ ),則 RNA容易降解,所以選用含甲酰胺的超級(jí)雜交液(B 型本產(chǎn)品),以便能在 42℃完成雜交。
3. 對(duì) Oligo 探針的雜交,雜交溫度一般比 Tm 低 5℃。由于 Oligo較短,更容易受各種因素影響(如錯(cuò)配率、修飾堿基比例等),所以溫度需要適度摸索和優(yōu)化。
三、確定洗膜溫度
一般使用 0.1×SSC 做洗膜液,在此條件下的洗膜溫度比 Tm 低5-12℃,一般情況下可以在 55℃進(jìn)行洗膜。Oligo 探針可以室溫洗膜。
四、預(yù)雜交步驟
預(yù)雜交就是用不含探針的本產(chǎn)品跟印跡膜進(jìn)行孵育,其目的是用所含的非特異性 DNA 分子(鮭精 DNA 或小牛胸腺 DNA)及其它高分子化合物將印跡膜上會(huì)非特異地吸附探針分子的位點(diǎn)封閉,否則這些位點(diǎn)會(huì)吸附標(biāo)記的探針,造成高背景。
1. 將結(jié)合了靶分子的硝酸纖維素印跡膜或尼龍印跡膜浸泡于自備的 6×SSC 溶液中,使其充分濕潤(rùn)。
2. 將濕潤(rùn)的印跡膜置于一塑料雜交袋中(塑料袋預(yù)先封口,再剪掉一角,留一個(gè)小口),按每平方厘米印跡膜加 0.2 mL 超級(jí)雜交液的比例沿小口加入超級(jí)雜交液,然后用塑料封口機(jī)將口封牢。
3. 將此塑料袋浸沒入溫度設(shè)定在雜交溫度的恒溫水浴中或雜交爐中,保溫 1-2 小時(shí),延長(zhǎng)到 12-16 小時(shí)亦可。注意保溫過程中塑料袋應(yīng)在不停的搖動(dòng)狀態(tài)中,使超級(jí)雜交液與印跡膜充分接觸。
五、雜交步驟
1. 如果標(biāo)記的探針是雙鏈核酸,則需經(jīng)變性處理。具體操作是將探針樣品在沸水浴中加熱 5 分鐘,然后迅速置冰浴中。如果是單鏈 DNA 或RNA 探針,則不需變性,直接使用。
2. 將單鏈探針或變性后的雙鏈探針加入到完成了預(yù)雜交的雜交袋中(先用剪刀剪一小口,加入探針后用熱封機(jī)封口)。探針的加入量視探針標(biāo)記效率而定,一般要求終濃度不能低于 1-2 ng/mL。如果檢測(cè)基因組中的單拷貝基因,探針的加入量應(yīng)加大,而對(duì)于檢測(cè)克隆的基因片段,則探針的量可減少。如果是放射性探針,應(yīng)將此塑料袋套在另一塑料袋之中,以避免雜交袋發(fā)生遺漏、污染工作環(huán)境。
3. 在選定的雜交溫度下繼續(xù)保溫,時(shí)間一般為 6-12 小時(shí)。
六、洗膜步驟。注意在下面的所有操作過程中,一定不要使印跡膜干燥。此步是將與印跡膜非特異結(jié)合的探針分子洗去而只留下特異結(jié)合的探針分子。由于非特異性雜交的雜交分子解鏈溫度較低,熱穩(wěn)定性較差,在一定的溫度和較低的離子強(qiáng)度下,即可洗掉。
1. 雜交完畢,取出塑料袋,剪去一角,倒出所有的含探針的雜交液。此含探針的雜交液可以多次使用再倒棄。
2. 剪開雜交袋,用鑷子取出印跡膜,浸沒于大量的 2×SSC(含 0.5 %SDS)溶液中,室溫下振蕩漂洗 15 分鐘。
3. 重復(fù)上步操作一次。
4. 將印跡膜轉(zhuǎn)移至 0.1×SSC(含 0.1% SDS)溶液中,在計(jì)算好的洗膜溫度下振蕩漂洗 30 分鐘至 1 小時(shí)。
5. 重復(fù)上步操作一次。如果是同位素標(biāo)記探針,則需要重復(fù)至用蓋革計(jì)數(shù)器在無核酸區(qū)域檢測(cè)不出放射信號(hào)為止。
6. 將印跡膜轉(zhuǎn)移到濾紙上,吸去表面液體后印跡膜即可用于后續(xù)檢測(cè)。
關(guān)鍵字: 超級(jí)雜交液(含甲酰胺)廠家;超級(jí)雜交液(含甲酰胺)現(xiàn)貨
上??道噬锟萍加邢薰臼且患壹邪l(fā)、生產(chǎn)、銷售、服務(wù)于一體的一家生物科技企業(yè),專營(yíng)生化試劑、標(biāo)準(zhǔn)品、基因、蛋白、抗體、Elisa試劑盒、細(xì)胞生物學(xué),分子生物學(xué)等高生物產(chǎn)品。總部位于上海,并在北京、廣東,江西,吉林等全國(guó)30多個(gè)省市設(shè)有分公司和代理機(jī)構(gòu)。涉及的產(chǎn)品被中國(guó)科學(xué)院、清華、北大、復(fù)旦,上海交大,復(fù)旦醫(yī)學(xué)院,上海中醫(yī)藥大學(xué),華東師范大學(xué),第二軍醫(yī)大學(xué),曙光醫(yī)院,浦東新區(qū)人民醫(yī)院等知名科研院所廣泛使用,可靠而穩(wěn)定的質(zhì)量和完善的售后服務(wù)確。