革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌質(zhì)粒DNAout 產(chǎn)品及特點(diǎn) 本試劑盒是用于從革氏陽(yáng)性(G+)細(xì)菌種小量制備質(zhì)粒 DNA。本產(chǎn)品基于改良后 的堿變性法,首先菌體經(jīng)溶菌酶破壁,然后堿裂解法處理使基因組 DNA 和質(zhì)粒 DNA 均變性,再用酸中和,質(zhì)粒 DNA 客戶快速?gòu)?fù)性,而基因組 DNA 不能快速?gòu)?fù)性,故 可以通過(guò)離心去除,除去后含質(zhì)粒的上清用離心吸附柱吸附質(zhì)粒 DNA,洗去雜質(zhì), 即可得到純化的質(zhì)粒 DNA。本產(chǎn)品具有下列特點(diǎn): 1. 快速、步驟少,整個(gè)操作在 40 分鐘左右完成。 2. 不需要預(yù)平衡離心吸附柱。 3. 通用洗柱液即開(kāi)即用,不需要用戶額外加乙醇。 4. 溶液 B 中有藍(lán)色染料,便于目測(cè)非常關(guān)鍵的堿變性和中和反應(yīng)兩步的溶液混勻狀 況,保證實(shí)驗(yàn)效果。 5. 產(chǎn)量高,一次可以處理 1-4 mL 過(guò)夜培養(yǎng)的 G+菌液,每毫升過(guò)夜培養(yǎng)的 G+細(xì) 菌可以提取到 2-5 ug/mL(取決于質(zhì)粒是高拷貝、中拷貝還是低拷貝)。 6. 純度高,采用本試劑盒提取的質(zhì)粒 OD 比值在 1.8-2.0 之間,可以直接用于酶切、 轉(zhuǎn)化、測(cè)序及 PCR 等。 革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌質(zhì)粒DNAout 規(guī)格及成分 成 份 編 號(hào) 大紙盒包裝 革氏陽(yáng)性質(zhì)粒 DNAout 溶液 A 120601a 13 mL 革氏陽(yáng)性質(zhì)粒 DNAout 溶液 B 120601b 13 mL 革氏陽(yáng)性質(zhì)粒 DNAout 溶液 C 120601c 18 mL 溶菌酶干粉(20KU/mg) 80103c 30mg(黃蓋) RNase A 溶液,10mg/mL 3160 0.6 mL 通用洗柱液 60408 50 mL DNA 洗脫液 2.0 111205 10 mL 離心吸附柱 60911 50 套 使用手冊(cè) 60205sc 1 份 革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌質(zhì)粒DNAout運(yùn)輸及保存 常溫運(yùn)輸和保存,RNase A 溶液需要-20℃保存,有效期一年。 自備試劑 無(wú) 使用方法 1. 從篩選平板上挑取單菌落至含抗生素的培養(yǎng)基中,37℃震蕩培養(yǎng) 12-16 小時(shí)(搖 床轉(zhuǎn)速 200-300)。注意:建議使用 LB 培養(yǎng)基,營(yíng)養(yǎng)更豐富的培養(yǎng)基會(huì)使菌體 濃度過(guò)高,超過(guò)純化系統(tǒng)處理能力而降低 DNA 質(zhì)量。另外,延長(zhǎng)培養(yǎng)時(shí)間會(huì)因 細(xì)胞死亡、裂解而造成質(zhì)粒 DNA 濃度降低。 2. 用 1.5 mL 離心管收集 1-4 mL 過(guò)夜培養(yǎng)飽和菌液,室溫 12,000 rpm 離心 1 分鐘,棄上清,再短暫離心,吸棄殘留液體。 3. 次使用本試劑盒時(shí),先將全部 RNase A 溶液全部加入到革氏陽(yáng)性質(zhì)粒 DNAout 溶液 A(簡(jiǎn)稱(chēng)溶液 A,下同)中,搖勻后再取用,未用完的溶液 A 放 4℃ 保存。 4. 加入 250 uL 溶液 A,用槍頭充分吹打使菌體重懸。注意:細(xì)胞未充分懸浮會(huì)影 響后續(xù)堿變性,可以使用漩渦振蕩器混勻或使用槍頭吸頭吹打沉淀至完全混勻。 5. 加入大約 5 mg 溶菌酶干粉(用 0.1mg 精度的分析天平稱(chēng)量),輕柔顛倒混勻后 室溫放置 10 分鐘破裂細(xì)胞壁。 6. 加入 250 uL 革氏陽(yáng)性質(zhì)粒 DNAout 溶液 B(下面簡(jiǎn)稱(chēng)溶液 B,如果溶液 B 在 低溫放置產(chǎn)生沉淀,須 37℃加熱溶解后冷卻到室溫方可使用),溫和反復(fù)顛倒混 勻看到溶液的藍(lán)色變得均勻并且溶液變粘即可(一般需要顛倒 4-6 次),然后冰 上放置不超過(guò) 5 分鐘。注意:冰上放置不要超過(guò) 5 分鐘,否則質(zhì)粒 DNA 會(huì)有堿 損傷。千萬(wàn)不要?jiǎng)×艺袷?,否則基因組 DNA 斷裂產(chǎn)生的片段非常容易污染質(zhì)粒 DNA。溶液 B 用后需要將蓋擰緊存放,否則空氣中的二氧化碳會(huì)進(jìn)入溶液,形 成碳酸,中和溶液 B 中的堿,降低其效率。如果溶液 B 顏色不是藍(lán)色,則表示 變質(zhì),應(yīng)該棄之不用并且速跟廠家聯(lián)系。 7. 加入 350 uL 冰上預(yù)冷的革氏陽(yáng)性質(zhì)粒 DNAout 溶液 C(下面簡(jiǎn)稱(chēng)溶液 C),溫 和反復(fù)顛倒直到溶液顏色變成無(wú)色(一般需要顛倒混勻 4-6 次)?;靹蚝罂梢?jiàn)白 色沉淀物產(chǎn)生,然后冰上放置至少 5 分鐘讓質(zhì)粒 DNA 復(fù)性。 8. 12,000 rpm 離心 3 分鐘,小心將上清液轉(zhuǎn)移到離心吸附柱中。由于此時(shí)的溶液 比重較大,部分沉淀物懸浮在上清液中屬正常,吸取上清時(shí)避開(kāi)漂浮的沉淀物即 可。如果此步的離心在 4℃進(jìn)行,可減輕沉淀物漂浮。 9. 靜置 2 分鐘以讓質(zhì)粒 DNA 與離心吸附柱充分結(jié)合,保證靜置不少于 2 分鐘十分 重要。 10. 室溫 12,000 rpm 離心 1 分鐘,棄收集管中的廢液。 11. 加入 500 uL 的通用洗柱液到離心吸附柱中,室溫 12,000 rpm 離心 1 分鐘, 棄收集管中廢液。注意:通用洗柱液中含乙醇,每次用后需要將蓋擰緊存放,否 則乙醇會(huì)揮發(fā)。 12. 重復(fù)上步 1 次。 13. 室溫 12,000 rpm 離心 1 分鐘,甩干殘留液體。此步不能省略,否則殘留乙醇 會(huì)影響 DNA 的后續(xù)使用(如殘留乙醇使 DNA 溶液在電泳上樣時(shí)不能沉淀到加 樣孔中)。 14. 將離心吸附柱置于一個(gè)新的 1.5 mL 塑料離心管(自備)中,加入 30-100 uL 65-80℃預(yù)熱的 DNA 洗脫液 2.0,室溫放置 2 分鐘。常溫的 DNA 洗脫液 2.0 也可以用于洗脫,但產(chǎn)量稍微有所降低。 15. 室溫 12,000 rpm 離心 1 分鐘,離心管底溶液即質(zhì)粒 DNA。 16. 由于基因的吸附柱結(jié)合 DNA 能力較強(qiáng),如果再加適量 DNA 洗脫液 2.0 到 離心吸附柱中,往往還能洗脫下很多質(zhì)粒 DNA(相當(dāng)于次洗脫的 20-30%), 但注意不要使用上步得到的 DNA 洗脫液 2.0 來(lái)洗脫。
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