染色質(zhì)免疫共沉淀（ChIP）是在體內(nèi)環(huán)境中研究蛋白質(zhì)與DNA相互作用的經(jīng)典實(shí)驗(yàn)方法，廣泛應(yīng)用于組蛋白修飾、特定轉(zhuǎn)錄因子的基因調(diào)控作用等相關(guān)領(lǐng)域。隨著新一代測(cè)序技術(shù)的發(fā)展和成熟，染色質(zhì)免疫沉淀實(shí)驗(yàn)與高通量測(cè)序的整合——Chromatin Immunoprecipitation Sequencing （ChIP Sequencing ），可在全基因組范圍對(duì)蛋白結(jié)合位點(diǎn)進(jìn)行高效而準(zhǔn)確的篩選與鑒定，同時(shí)也為研究的深入開(kāi)展打下基礎(chǔ)。
?? ? ? 采用特異性抗體對(duì)目的蛋白進(jìn)行免疫沉淀后，分離與其結(jié)合的基因組DNA片段，再通過(guò)高通量測(cè)序與數(shù)據(jù)分析，在全基因組范圍內(nèi)尋找目的蛋白的DNA結(jié)合位點(diǎn)，并且可以基于多個(gè)樣品進(jìn)行差異比較。

技術(shù)優(yōu)勢(shì):

• 檢測(cè)范圍廣：全基因組范圍的免疫沉淀與測(cè)序分析；
• 高性價(jià)比：基于抗體富集目標(biāo)區(qū)域，有效降低測(cè)序數(shù)據(jù)量；
• 微量樣本：只需10 ng以上免疫沉淀后的DNA，即可進(jìn)行測(cè)序分析。

研究?jī)?nèi)容:
一、標(biāo)準(zhǔn)信息分析?
1)???????? 去接頭污染，去低質(zhì)量reads和產(chǎn)量情況統(tǒng)計(jì)；
2)???????? ChIP 測(cè)序序列與參考基因組序列的比對(duì)；
3)???????? ChIP 測(cè)序Reads 在全基因組的分布；
4)???????? 統(tǒng)計(jì)ChIP測(cè)序數(shù)據(jù)富集區(qū)域( Peak ) 的信息；
5)???????? Peak相關(guān)基因篩選與GO功能聚類分析；
6)???????? 多個(gè)樣品的差異分析；
7)???????? UCSC Genome Browser使用說(shuō)明；
二、高級(jí)信息分析
?不同表達(dá)水平的基因在TSS附近區(qū)域的reads 富集程度。
三、定制化信息分析
可結(jié)合客戶的需求，協(xié)商確定定制化信息分析內(nèi)容。?
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