SolarRed是一種靈敏、穩(wěn)定和相對安全的熒光核酸染色試劑。它可以替代高毒性染色劑－溴化乙錠（EB），用于瓊脂糖凝膠或聚丙烯酰胺凝膠中dsDNA和ssDNA的染色。SolarRed的靈敏度遠(yuǎn)高于EB，并且不需要脫色。由于SolarRed和EB有相同的光譜特性，因此用它替代EB時不需要更換成像系統(tǒng)。

SolarRed既可用于預(yù)制凝膠也可用于電泳后染色。通常電泳后染色的靈敏度更高，并能排除染料對DNA遷移的干擾。使用SolarRed進(jìn)行電泳后染色，操作簡單不需要脫色和特殊溶液。只要將染料稀釋在0.1M NaCl中，并將凝膠置于染色液中，30分鐘后就可以觀察。染色液在室溫下極為穩(wěn)定，可以多次反復(fù)使用。相比而言，預(yù)制凝膠由于不需要額外染色過程，因此染料用量更少，更為簡單經(jīng)濟(jì)。

除了無與倫比的靈敏度和穩(wěn)定性外，獨(dú)立實驗室的毒性測試也顯示，在凝膠染色的濃度下，SolarRed沒有誘變性和細(xì)胞毒性。SolarRed安全性的關(guān)鍵在于它對于細(xì)胞膜完全沒有通透性。

染料特點：

1、無毒性：SolarRed獨(dú)特的油性和大分子量特點使其不能穿透細(xì)胞膜進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)，艾姆斯氏試驗結(jié)果也表明，該染料的誘變性遠(yuǎn)遠(yuǎn)小于EB。

2、靈敏度高：適用于各種大小片段的電泳染色，對核酸遷移的影響小于SYBR Green I。

3、穩(wěn)定性高： 適用于使用微波或其它加熱方法制備瓊脂糖凝膠;室溫下在酸或堿緩沖液中極其穩(wěn)定，耐光性強(qiáng)。

4、信噪比高：樣品熒光信號強(qiáng)，背景信號低。

5、操作簡單：與 EB 一樣，在預(yù)制膠和電泳過程中染料不降解;而電泳后染色過程也只需30 分鐘且無需脫色或沖洗 ，即可直接用紫外凝膠透射儀觀察。

6、適用范圍廣：可選擇電泳前染色(膠染法)或電泳后染色(泡染法);適用于瓊脂糖凝膠或聚丙烯酰胺凝膠電泳;可用于 dsDNA、ssDNA 或 RNA 染色。

與EB有相同的光譜特性，無需改變?yōu)V光片及觀察裝置：標(biāo)準(zhǔn)的 EB 濾光片或 SYBR 濾光片都適用，使用與觀察EB相同的普通紫外凝膠透射儀觀察即可。但是SolarRed不能被488 nm氬離子激光器或相似波長的可見光完全激發(fā)，因此不推薦使用此類激發(fā)裝置的成像系統(tǒng)。對于此類裝置，我們推薦您使用solarGreen (Cat# G5570)，它和SYBR Green I 的光譜相似，靈敏度相當(dāng)，但更加穩(wěn)定。

SolarRed 使用方法簡介

1.膠染法(用法同EB)(推薦方法)

(1) 制膠時加入SolarRed核酸染料(例如：每50mL 瓊脂糖溶液中加入5μL SolarRed 10,000× 儲液，以此比例類推)。

(2) 按照常規(guī)方法進(jìn)行電泳。

注意事項：

(1) 此方法染色染料用量相對較少。500 μL染料大約可以做100塊 50mL的膠。

(2) 由于SolarRed具有良好的熱穩(wěn)定性，可以在熱的瓊脂糖溶液中直接添加，而不需要等待溶液冷卻。搖晃，振蕩或者翻轉(zhuǎn)以保證染料充分混勻。也可以選擇將SolarRed儲液加到瓊脂糖粉末和電泳緩沖液中，然后用微波爐或其他常用方式加熱以制備瓊脂糖凝膠。SolarRed兼容幾乎所有常用的電泳緩沖溶液。

(3) 如果總是看到條帶彌散或分離不理想，建議使用泡染法染色以確認(rèn)問題是否與染料有關(guān)。如果染色后問題依舊存在，則說明問題與染料無關(guān)，請嘗試：降低瓊脂糖濃度;選用更長的凝膠;延長凝膠時間以保證邊緣清晰;改進(jìn)上樣技巧或選擇泡染法染色。

(4) 此方法不適合預(yù)制聚丙烯酰胺凝膠，對于聚丙烯酰胺凝膠請使用泡染法。

2.泡染法

(1) 按照常規(guī)方法進(jìn)行電泳。

(2) 用H2O將SolarRed 10,000× 儲液稀釋約3,300倍到0.1M NaCl中，制成3× 染色液。(例如將15μL SolarRed 10,000× 儲液和5mL 1M NaCl加到45mL H2O中)。

(3) 將凝膠小心地放入合適的容器中，如聚丙烯容器中。緩慢加入足量的3× 染色液浸沒凝膠。室溫振蕩染色30min左右，染色時間根據(jù)凝膠厚度以及瓊脂糖濃度不同而略有不同。對于含3.5～10%丙烯酰胺的凝膠，染色時間通常介于30min到1h，并隨丙烯酰胺含量增加而延長。

注意事項：

(1) 用泡染法染色時，染料用量較多。單次使用的染色液可重復(fù)使用3次左右。

(2) 3×SolarRed染色液可以大量制備，在室溫下避光保存直至用完。

特別提醒：

(1) 如果您使用的是紫外成像儀，請選擇SolarRed ;如果您使用激光成像儀或希望在可見光下觀測，請選擇SolarGreen。

(2) 在極少數(shù)情況下，質(zhì)粒經(jīng)某些酶切后的DNA樣品會出現(xiàn)拖尾和分辨率降低，此時建議同時嘗試兩種染色方法以決定哪種方法更加合適。