??????碧云天的NA-Green (Nucleic Acid Green,核酸綠)是一種EB (Ethidium bromide,溴化乙錠)的升級換代產(chǎn)品,用于凝膠中DNA、RNA等核酸的染色。NA-Green具有安全(未檢測到致突變性和細胞毒性)、靈敏度高、穩(wěn)定性好等優(yōu)點,凝膠中的核酸在使用本產(chǎn)品后經(jīng)約500nm波長藍光(也可以使用約260nm紫外光)激發(fā)呈現(xiàn)綠色熒光,適用于原先使用SYBR Green或SYBR Gold為核酸染料的凝膠成像和檢測系統(tǒng)。 ??????由于NA-Green在500nm左右處有的激發(fā)波長,可以使用對人體無害的藍光燈或藍光成像儀進行核酸檢測,從而避免常規(guī)的紫外檢測對核酸樣品的致突變性,以及紫外對人的眼睛和皮膚的傷害。特別在切膠回收時,使用NA-Green并用藍光燈具有很大的優(yōu)勢,不僅可以避免核酸樣品的突變,也可以避免紫外光對人體的傷害。 ??????NA-Green比EB或SYBR Green更安全。NA-Green在遠高于其工作濃度范圍時均沒有細胞毒性及誘變性。艾姆斯氏試驗(Ames test)結(jié)果表明,即使在S9代謝活化時,也沒有檢測到致突變性。NA-Green和碧云天另外一種安全型核酸染料NA-Red,由于它們特殊的化學結(jié)構(gòu)使其難以進入細胞,從而大大降低甚至避免了染料的致突變性和細胞毒性。艾姆斯氏試驗結(jié)果表明,NA-Green比NA-Red更安全,即便在S9代謝活化時,當NA-Green濃度高達約20微克/毫升時,也沒有檢測到致突變性。而SYBR Green染料可以穿透細胞膜,進入活細胞并染色DNA。并且有報道SYBR Green可以強烈增強紫外線誘導的基因突變。 ??????NA-Green檢測靈敏度高,對于小分子量核酸的染色效果好。NA-Green的檢測靈敏度比EB高8-10倍,在檢測低濃度、微量DNA或RNA方面比EB更佳,尤其對小分子量的DNA檢測非常靈敏。在使用浸泡染色法時,NA-Green和SYBR Gold的靈敏度相近甚至更高;與SYBR Gold不同的是,NA-Green預先配制在凝膠中也有很高的靈敏度。EB對于小分子量核酸染色效果差,而NA-Green對于小分子量核酸的染色效果很好,便于觀察酶切或PCR獲得的小分子量核酸片段。本說明書推薦使用的NA-Green濃度,其檢測效果略優(yōu)于EB。如果希望獲得更高的染色靈敏度,可以適當提高NA-Green的工作濃度。 ??????NA-Green的穩(wěn)定性好,染色重復性高。含SYBR Green的凝膠核酸染色的重復性比較差,這通常是由于SYBR系列染料的穩(wěn)定性差導致的。而NA-Green的穩(wěn)定性很好,可以室溫長時間保存及使用微波爐加熱。NA-Green的光穩(wěn)定性良好,可以在室內(nèi)正常光線下操作而無需避光。由于其熱穩(wěn)定性和光穩(wěn)定性,含NA-Green的凝膠在核酸染色時的重復性非常好。 ??????NA-Green可以使用和SYBR Green或EB相同的檢測體系。NA-Green具有和SYBR Green或SYBR Gold幾乎相同的光學性質(zhì),兩者的激發(fā)光和發(fā)射光都非常接近,這樣可以直接用NA-Green替換SYBR Green,以使用SYBR Green的凝膠觀察、拍照或成像系統(tǒng)(約500nm激發(fā))。對于原來用于EB染料觀察的系統(tǒng),可以考慮選用碧云天的NA-Red染料來替代EB,但也可以使用沒有致突變性的NA-Green來替代EB。使用NA-Green來替代EB,并且用EB的紫外檢測體系時,檢測靈敏度會比使用NA-Red低約4-5倍。對于既可以觀察EB也可以觀察SYBR Green的具有紫外和藍光兩種激發(fā)光的凝膠成像系統(tǒng),則推薦直接用NA-Green來替換EB。NA-Green的激發(fā)光譜和發(fā)射光譜請參考圖1。
圖1. NA-Green的激發(fā)光譜和發(fā)射光譜
??????NA-Green的使用方法和EB一致。NA-Green可以按適當比例直接加入瓊脂糖中配制成凝膠,也可以在電泳完畢后對凝膠進行染色。前者更加方便,而后者靈敏度要更加高一些。但由于NA-Green本身已經(jīng)非常靈敏,通常采用把NA-Green直接配制在凝膠中就可以了。對于一些特殊的情況,如核酸樣品量特別少的情況等,則可以考慮電泳后再對凝膠進行染色。 ??????NA-Green對于核酸的遷移率影響非常小,小于SYBR Green對于核酸遷移率的影響。 ??????通過凝膠回收試劑盒(如碧云天或Qiagen的凝膠回收試劑盒)或酚氯仿抽提,可以有效去除與DNA或RNA結(jié)合的NA-Green,從而確保不會影響后續(xù)的連接、酶切、PCR、測序等常規(guī)的分子生物學用途。 包裝清單:
保存條件: ??????室溫避光保存,至少一年有效。 注意事項: ??????為確保使用的不是假冒的NA-Green,可以用細胞培養(yǎng)液把NA-Green稀釋至1X,然后對培養(yǎng)的活細胞進行染色。隨后在熒光顯微鏡下嘗試用各種激發(fā)光觀察,如果發(fā)現(xiàn)活細胞細胞核出現(xiàn)明顯的熒光,則可以判定為假冒產(chǎn)品。如果各種激發(fā)光下活細胞均無熒光,則說明該核酸染料是不能進入活細胞的相對安全的染料。具有強致突變性的吖啶橙(Acridine Orange)染色核酸后也呈現(xiàn)綠色熒光,但其可以染色活細胞,而NA-Green不會染色活細胞。 ??????使用藍光燈來檢測NA-Green染色的核酸膠時,需要注意避免使用一些實為紫外燈的假冒偽劣的藍光燈,以減少紫外線對于核酸樣品和人體的傷害。比較簡單的判斷方法是,對于EB或NA-Red染色的核酸膠,藍光燈照射后是不會出現(xiàn)熒光條帶的,而僅對于NA-Green染色的核酸膠,藍光燈照射后才會出現(xiàn)熒光條帶。如果對于EB或NA-Red染色的核酸膠照射后也能觀察到熒光條帶,則說明使用的藍光燈實際為紫外燈。 ??????NA-Green和EB一樣作為熒光染料均需避光保存,但在使用過程中的常規(guī)室內(nèi)光照不會影響其使用效果。 ??????制備好的NA-Green瓊脂糖凝膠,在4℃避光條件下通??梢员4?-5天。 ??????NA-Green瓊脂糖凝膠再次熔化使用時,為取得更好的觀察效果,需要添加適量NA-Green。 ??????電泳之后的凝膠不建議重復使用。 ??????電泳后再使用NA-Green染色的凝膠一般不需要脫色,如果發(fā)現(xiàn)背景太高,可以使用不含核酸酶的水進行脫色處理。 ??????NA-Green和NA-Red除了可以染色雙鏈DNA外,也可染色單鏈DNA和RNA。NA-Red對單鏈核酸的染色靈敏度約為對雙鏈DNA染色靈敏度的一半。NA-Red對單鏈核酸的染色靈敏度約為NA-Green的5倍。 ??????如果使用聚丙烯酰胺凝膠,請使用浸泡染色法染膠,并延長染色時間至30分鐘-1小時。 ??????如果觀察到條帶彌散或者分離不理想,建議使用浸泡染色法染色以確認是否與染料有關。如果浸泡染色法染色后仍然出現(xiàn)類似的問題,說明與染料無關,請嘗試以下方法:使用新鮮配制的電泳緩沖液、降低核酸的上樣量、降低染料的濃度、降低瓊脂糖濃度、選用更長的凝膠、降低電泳電壓一倍以上并延長凝膠電泳時間以改善電泳效果、使用更薄的梳齒等。 ??????本產(chǎn)品兼容常用的電泳緩沖液,例如TAE和TBE。 ??????NA-Green適用于約500nm或260nm激發(fā)的成像系統(tǒng),如果使用普通的適用于NA-Red或EB的紫外燈或成像系統(tǒng)(約300nm激發(fā)),也能較好地觀察到熒光,但強度會略弱一些。 ??????NA-Green不屬于有毒有害物質(zhì),并通過了環(huán)境安全相關測試,相關廢棄物無需特殊處理,可參考常規(guī)化學試劑進行處理。 ??????本產(chǎn)品僅限于專業(yè)人員的科學研究用,不得用于臨床診斷或治療,不得用于食品或藥品,不得存放于普通住宅內(nèi)。 ??????為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作。
碧云天生物技術有限公司
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