Illumina全基因組分型芯片采用Infinium技術(shù),該技術(shù)無(wú)需PCR反應(yīng),不依賴(lài)限制性?xún)?nèi)切酶,在SNP位點(diǎn)的選擇上可以完全根據(jù)基因組情況來(lái)選擇,芯片反應(yīng)通過(guò)等位基因特異性延伸來(lái)完成,保證了高質(zhì)量的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。SNP是迄今為止分布最為廣泛、存在數(shù)量最多的一種遺傳多態(tài)性。SNP的研究將幫助我們尋找新的遺傳病的致病基因或易感基因,認(rèn)識(shí)人種、人群、個(gè)體間的遺傳差異,疾病與個(gè)體差異的關(guān)系以及個(gè)體差異對(duì)藥物的耐藥性存在的不同的反應(yīng)能力。
芯片名稱(chēng):Human omni-1 quad beadchip
芯片信息:Human omni-1 quad 芯片數(shù)據(jù)來(lái)自于人類(lèi)千人基因組計(jì)劃測(cè)序結(jié)果。其中包含了超過(guò)114 萬(wàn)個(gè)探針信息,可以在一張芯片上平行進(jìn)行4 個(gè)樣本的檢測(cè)。該款芯片包含針對(duì)基因SNPs、標(biāo)簽SNPs、拷貝數(shù)變化(CNV)及其他高價(jià)值的基因組區(qū)基因組區(qū)域域設(shè)計(jì)探針。
芯片名稱(chēng):Human omni express-12 beachip
芯片信息:含蓋人類(lèi)基因組計(jì)劃HapMap三個(gè)階段研究的數(shù)據(jù),針對(duì)基因SNPs、標(biāo)簽SNPs、拷貝數(shù)變化(CNV)及其他高價(jià)值的基因組區(qū)域設(shè)計(jì)探針,共700,000多個(gè)位點(diǎn),每張芯片可同時(shí)檢測(cè)12個(gè)樣本。在r2 > 0.8 前提下,在CEU、JPT+CHB、YRI等人種中基因組覆蓋率分別為:0.91、0.91、0.68。CNV區(qū)域平均間隔4.0kb。
芯片名稱(chēng):Human omni-zhonghua-8 beachip
芯片信息:此芯片是一款專(zhuān)為中國(guó)人設(shè)計(jì)的全基因組SNP基因分型芯片,每張芯片做8個(gè)樣品,芯片覆蓋了在中國(guó)人群體中發(fā)現(xiàn)的常有和稀有變異,適用于全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)。經(jīng)優(yōu)化的90萬(wàn)個(gè)標(biāo)簽SNP信息來(lái)自HapMap所有三個(gè)階段及千人基因組計(jì)劃(1kGP),并經(jīng)策略性選擇,可用于在中國(guó)人種群中探索全新的疾病和性狀關(guān)聯(lián)。
芯片名稱(chēng):Infinium Human Exome BeadChip
芯片信息:Human Exome BeadChip芯片前所未有地覆蓋了推定的功能性外顯子變異,這些變異精選自12,000多個(gè)個(gè)體的外顯子組和全基因組序列。外顯子內(nèi)容包含了> 240,000個(gè)標(biāo)志物,它們代表了不同群體—包括歐洲、非洲、中國(guó)和西班牙個(gè)體—以及多種常見(jiàn)病,如II型糖尿病、癌癥、代謝及精神疾病。
芯片名稱(chēng):Cyto SNP-12 BeadChip
芯片信息:Cyto SNP-12 BeadChip 芯片,包含30萬(wàn)個(gè)和疾病相關(guān)的遺傳標(biāo)。數(shù)據(jù)來(lái)源于Hapmap I和II。
芯片名稱(chēng):Omni2.5-Quad BeadChip
芯片信息:Omni2.5-Quad BeadChip芯片,包含250萬(wàn)個(gè)SNP探針及CNV探針。用于基因分型和全基因組CNV分析,平均間隔1.2kb,MAF>2.5%。數(shù)據(jù)來(lái)源于Hapmap I到III和1000 Genomes。
芯片名稱(chēng):Omni5-Quad BeadChip
芯片信息:Omni5-Quad BeadChip芯片,包含500萬(wàn)個(gè)SNP探針及CNV探針。用于基因分型和全基因組CNV分析,平均間隔0.6kb,MAF>1%。數(shù)據(jù)來(lái)源于Hapmap I到III和1000 Genomes。