英文名稱：Cyanine3.5 amine
Cyanine3.5-NH2
中文名稱：Cy3.5 氨基
分子式：C44H56Cl2N4O
分子量：727.85
外觀：固體或粉末
純度：>95%
ex/em : 591/604 nm (PBS緩沖液)
消光系數(shù)(ε) : 116000 L?mol?1?cm?1
量子產(chǎn)率(Φ) : 0.35
溶解性 :可溶于氯仿，甲醇，乙腈，DMF等有機溶劑，難溶于水
保存條件 :避光，干燥，-20oC保存
結構式：
Cy3.5 (Cyanine 3.5) 是一種發(fā)紅色熒光的花青素類熒光染料。Cy3.5在顯影時可以用561nm或者594nm的激光束激發(fā)然后用 Texas Red? 相似的濾片觀察，它是一種非常常用的標記染料。Cy3.5-NHS可以用來標記蛋白，抗體，多肽，核酸分子，納米粒等。
胺基(primary amine)是生物標記反應中常用的基團。蛋白表面賴氨酸側鏈(residue)官能團就是伯氨基，伯胺基可以和NHS活化酯(N-羥基琥珀酰亞胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester)，異氰酸酯(isothiocyanate, ITC)或其它活化基團反應生成穩(wěn)定鏈接，從而把Cy3.5分子連接到目標分子上。
Cy3.5-伯胺的水溶性較低，所以在水相的標記反應體系內(nèi)需要使用有機共溶劑，常用有機溶劑包括DMF，DMSO和乙腈等。如需標記的分子對有機溶劑敏感，可選擇磺化花青素（sulfonated cyanine），即磺化-Cy3.5-伯胺( D10031 )。兩者的光譜性質幾乎一致，因此大部分應用可相互替換。兩者的主要區(qū)別在于：磺化染料是水溶性的，在水相的標記反應體系內(nèi)不需要使用有機共溶劑，并且降低染料在水中聚集的可能性，增強標記效率。
Cy3.5-伯胺標記后的產(chǎn)物Ex/Em是591nm/604nm。和它具有相似熒光特性的染料包括Texas Red?，Alexa Fluor 594, BODIPY? TR, DyLight 594等。
注意事項
Cy3.5-伯胺水溶性較低，標記反應可在有機溶劑中進行或者含有機助溶劑的水相中進行。
標記時使用不含氨基的緩沖體系，比如磷酸鈉緩沖液（PBS），Hepes緩沖液，碳酸氫鈉緩沖液；或硼酸緩沖液等。不要使用任何含伯胺或仲胺的緩沖液，比如Tris，甘氨酸等，它們會和Cy3.5上的伯胺競爭。高濃度咪唑(imidazole)也會影響反應。
標記反應不要放在強光下，因為大部分熒光化合物在強光下長時間照射會緩慢光漂泊(photobleaching)。
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關鍵字： Cyanine3.5 amine;Cyanine3.5-NH2;Cy3.5 NH2;花青素Cy3.5 氨基;
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