生物信息學(xué)( bioinformatics )是建立在數(shù)學(xué)、計算機科學(xué)和生命科學(xué)基礎(chǔ)之上的一門交叉科學(xué)。它包括生物信息的獲取、加工、存儲、分發(fā)、分析和解釋等各方面,綜合運用數(shù)學(xué)、計算機科學(xué)和生物學(xué)的各種工具,來闡明和理解大量數(shù)據(jù)所包含的生物學(xué)意義。
生物信息學(xué)的出現(xiàn)極大地推動了分子生物學(xué)、基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)等的發(fā)展,已經(jīng)成為醫(yī)學(xué)、農(nóng)學(xué)、生物學(xué)等學(xué)科發(fā)展的強大推動力,也是藥物設(shè)計、環(huán)境監(jiān)測等的重要技術(shù)支撐。生物信息學(xué)在基因的功能發(fā)現(xiàn)、疾病基因診斷、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測、基于結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計、藥物合成和制藥工業(yè)中起著極其重要的作用,生物信息學(xué)的應(yīng)用大大加快了藥物的研究開發(fā)進程。
一、常規(guī)RNAseq,DNAseq分析,及后續(xù)個性化分析
1.1 GO分析:
1.2 KEGG分析
1.3 Reactome分析:
二、代謝組常規(guī)及個性化分析,代謝組轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析
三、繪制遺傳圖譜:
四、文章、GEO數(shù)據(jù)挖掘分析。
五、常規(guī)及個性化統(tǒng)計作圖。
六、正常樣本和腫瘤樣本測序后聯(lián)合分析-體細(xì)胞變異和胚系變異均可:
七、TCR、BCR免疫分析:
八、基因家族分析:
九、單細(xì)胞、微生物多樣性、宏基因組等具體評估確定。
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