根系分析儀是一套用于專業(yè)的根系分析系統(tǒng)軟件，在獲得掃描圖像后通過該軟件能夠快速簡便地獲得根系總長度、投影面積、表面積、平均直徑、總體積、根尖數(shù)、根的分叉數(shù)、根系交疊數(shù)等指標，廣泛運用于根系形態(tài)和構造研究．側蒴蘚類植物呈匍匐狀，其整體形態(tài)、分枝特點等類似于被子植物中的根系． 根系的形態(tài)特點可以用總長度、分枝數(shù)、突出數(shù)、投影面積、表面積、直徑、體積等參數(shù)進行描述，而側蒴蘚類的配子體枝條總長度、分枝數(shù)、表面積、枝( 帶葉) 莖和枝的直徑等與根須的有很強的對應性． 但是，并不清楚側蒴蘚類的這些性狀是否在科級水平上相對穩(wěn)定．如果性狀特征在遺傳上相對穩(wěn)定，則隨著環(huán)境變化引起的上述指標在個體間的差異是環(huán)境差異引起的可塑性變化．
根系分析儀可分析測量：
1）根總長；2）根平均直徑；3）根總面積；4）根總體積；5）根尖計數(shù)；6）分叉數(shù)；7）交叉數(shù)；8）根直徑等級分布參數(shù)；9）可不等間距地自定義分段直徑，自動測量各直徑段長度、投影面積、表面積、體積等，及其分布參數(shù)；10）根尖段長分布；
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