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別名: 4-Deoxyuridine
Zebularine (NSC 309132, 4-Deoxyuridine)是一種DNA methylation抑制劑,與DNA methyltransferases形成共價復合物,也抑制胞苷脫氨酶,無細胞試驗中Ki為2 μM。
Zebularine (NSC 309132) Chemical Structure
CAS: 3690-10-6
相關靶點 | TET DNMT1 DNMT3 | 點擊展開 |
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相關產(chǎn)品 | RG108 SGI-1027 Gamma-Oryzanol Bobcat339 hydrochloride CM272 GSK3685032 β-thujaplicin | 點擊展開 |
相關化合物庫 | 激酶抑制劑庫 FDA藥物庫 天然產(chǎn)物庫 已知活性藥物庫-I 生物活性庫Ⅱ | 點擊展開 |
細胞系 | 實驗類型 | 給藥濃度 | 孵育時間 | 活性描述 | 文獻信息 |
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human T24 cells | Function assay | 100 μM | 8 days | Induction of p16 gene expression in human T24 cells at 100 uM after 8 days by real time PCR in presence of 100 mM thymidine | 19006382 |
human HCT15 cells | Function assay | 100 μM | 8 days | Induction of p16 gene expression in human HCT15 cells at 100 uM after 8 days by real time PCR in presence of 100 mM thymidine | 19006382 |
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產(chǎn)品描述 | Zebularine (NSC 309132, 4-Deoxyuridine)是一種DNA methylation抑制劑,與DNA methyltransferases形成共價復合物,也抑制胞苷脫氨酶,無細胞試驗中Ki為2 μM。 | ||||
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特性 | Zebularine是非常穩(wěn)定的,37°C下,溶于PBS,pH 1.0時半衰期約為44小時,pH 7.0時半衰期約為508小時。 | ||||
靶點 |
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體外研究(In Vitro) | ||||
體外研究活性 | Zebularine是一種胞苷類似物,含有2-(1H)-嘧啶酮環(huán),最初合成作為胞苷脫氨酶抑制劑。[2]Zebularine與細菌甲基轉移酶形成緊密的共價復合物。[1]Zebularine作用于N. crassa,抑制DNA甲基化,并重新激活甲基化導致的沉默基因。Zebularine是DNA甲基化抑制劑,與5-Aza-CR相似,而不是一種選擇性抑制劑。Zebularine作用于T24膀胱癌細胞,重新激活沉默的p16基因,且去甲基化其啟動子區(qū)域。Zebularine作用于T24細胞,只具有輕微的細胞毒性。[3]與正常成纖維細胞相比,Zebularine優(yōu)先摻入癌細胞系的DNA ,且更大程度抑制細胞生長和基因表達。另外,與正常成纖維細胞相比,Zebularine優(yōu)先耗盡癌細胞的DNA甲基轉移酶1(DNMT1),且誘導癌癥相關的抗原基因的表達。[4] | |||
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實驗圖片 | 檢測方法 | 檢測指標 | 實驗圖片 | PMID |
Western blot | MeCP2 / MBD2 / MBD3 / Acetyl-H3 / Acetyl-H4 CDK2 / p-Rb / Rb DNMT1 / DNMT3a / DNMT3b | 19459041 | ||
Growth inhibition assay | Cell viability | 19459041 |
體內(nèi)研究(In Vivo) | ||
體內(nèi)研究活性 | Zebularine處理攜帶腫瘤的小鼠,具有輕微的細胞毒性(Zebularine按1000 mg/kg劑量處理小鼠,平均最大重量變化為11%[95%CI=4%至19%)。與對照組小鼠相比,高劑量Zebularine腹腔注射或口服飼喂處理小鼠的腫瘤體積顯著減小。[3] | |
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動物實驗 | Animal Models | 雄性BALB/c nu/nu 小鼠 |
Dosages | 500 mg/kg, 1000 mg/kg | |
Administration | 腹腔注射,口服飼喂 |
分子量 | 228.2 | 分子式 | C9H12N2O5 |
CAS號 | 3690-10-6 | SDF | Download Zebularine (NSC 309132) SDF |
Smiles | C1=CN(C(=O)N=C1)C2C(C(C(O2)CO)O)O | ||
儲存條件(自收到貨起) | |||
體外溶解度 |
DMSO : 46 mg/mL ( (201.57 mM) ;DMSO吸濕會降低化合物溶解度,請使用新開封DMSO) Water : 46 mg/mL (201.57 mM) Ethanol : Insoluble |
摩爾濃度計算器 |
體內(nèi)溶解度 現(xiàn)配現(xiàn)用,請按從左到右的順序依次添加,澄清后再加入下一溶劑 |
動物體內(nèi)配方計算器 |
動物體內(nèi)配方計算器(澄清溶液)
第一步:請輸入基本實驗信息(考慮到實驗過程中的損耗,建議多配一只動物的藥量)
第二步:請輸入動物體內(nèi)配方組成(配方適用于不溶于水的藥物;不同批次藥物配方比例不同,請聯(lián)系Selleck為您提供正確的澄清溶液配方)
計算結果:
工作液濃度: mg/ml;
DMSO母液配制方法: mg 藥物溶于μL DMSO溶液(母液濃度mg/mL,注:如該濃度超過該批次藥物DMSO溶解度,請先聯(lián)系Selleck);
體內(nèi)配方配制方法:取μL DMSO母液,加入μL PEG300,混勻澄清后加入μL Tween 80,混勻澄清后加入μL ddH2O,混勻澄清。
體內(nèi)配方配制方法:取μL DMSO母液,加入μL Corn oil,混勻澄清。
注意:1. 首先保證母液是澄清的;
2.一定要按照順序依次將溶劑加入,進行下一步操作之前必須保證上一步操作得到的是澄清的溶液,可采用渦旋、超聲或水浴加熱等物理方法助溶。
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